RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		12.92	□□□□□ -0.34
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		12.92	□□□□□ -0.34
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		12.91	□□□□□ -0.34
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	12.91	□□□□□ -0.34
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYOM2	P54296	1465 aa		12.91	□□□□□ -0.34
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LAMC1	P11047	1609 aa		12.9	□□□□□ -0.34
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MLEC	Q14165	292 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLFN14	P0C7P3	912 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		12.89	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAPN2	P17655	700 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MCTP1	Q6DN14	999 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FEZ1	Q99689	392 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TIGD1	Q96MW7	591 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OGFR	Q9NZT2	677 aa		12.88	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MPND	Q8N594	471 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		12.87	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD7	Q92527	254 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBTB9	Q96C00	473 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC66	A2RUB6	948 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF214	Q8ND24	703 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TULP2	O00295	520 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNR	Q92752	1358 aa		12.85	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF2C	Q99661	725 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		12.84	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZFYVE9	O95405	1425 aa		12.83	□□□□□ -0.35
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYCE3	A1L190	88 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RLBP1	P12271	317 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPT2	Q8TD30	523 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IDI1	Q13907	227 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNN	Q9UQP3	1299 aa		12.83	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	APAF1	O14727	1248 aa		12.82	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IQGAP1	P46940	1657 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TERF2	Q15554	542 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		12.81	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PIK3C2G	O75747	1445 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RGL3	Q3MIN7	710 aa		12.8	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP2R1A	P30153	589 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MMP14	P50281	582 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NGEF	Q8N5V2	710 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		12.79	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPRM	P28827	1452 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SOX12	O15370	315 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLIT1	O75093	1534 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ERICH4	A6NGS2	130 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PKP1	Q13835	747 aa		12.78	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		12.77	□□□□□ -0.36
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		12.77	□□□□□ -0.37
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		12.77	□□□□□ -0.37

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