RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.52■■■□□ 2.32
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UBXN4-204ENST00000426921 SLC15A2Q16348 729 aa28.96■■■□□ 2.23
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UBXN4-204ENST00000426921 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
UBXN4-204ENST00000426921 NBPF4Q96M43 638 aa28.96■■■□□ 2.23
UBXN4-204ENST00000426921 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
UBXN4-204ENST00000426921 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.94■■■□□ 2.22
UBXN4-204ENST00000426921 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa28.94■■■□□ 2.22
UBXN4-204ENST00000426921 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.94■■■□□ 2.22
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