RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424699.5

PRKRA-202, Transcript of protein activator of interferon induced protein kinase EIF2AK2, humanhuman

TSL 2

Gene PRKRA, Length 1,616 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRA-202ENST00000424699 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.54■■■□□ 2.32
PRKRA-202ENST00000424699 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.53■■■□□ 2.32
PRKRA-202ENST00000424699 CGNL1Q0VF96 1302 aa29.53■■■□□ 2.32
PRKRA-202ENST00000424699 RGS12O14924 1447 aa29.53■■■□□ 2.32
PRKRA-202ENST00000424699 RXRBP28702 533 aa29.52■■■□□ 2.32
PRKRA-202ENST00000424699 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
PRKRA-202ENST00000424699 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
PRKRA-202ENST00000424699 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PRKRA-202ENST00000424699 VPS72Q15906 364 aa29.49■■■□□ 2.31
PRKRA-202ENST00000424699 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PRKRA-202ENST00000424699 WNK3Q9BYP7 1800 aa29.49■■■□□ 2.31
PRKRA-202ENST00000424699 MAP3K19Q56UN5 1328 aa29.48■■■□□ 2.31
PRKRA-202ENST00000424699 ABCC6O95255 1503 aa29.48■■■□□ 2.31
PRKRA-202ENST00000424699 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
PRKRA-202ENST00000424699 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
PRKRA-202ENST00000424699 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 KNSTRNQ9Y448 316 aa29.45■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.44■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.44■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 USP35Q9P2H5 1018 aa29.43■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 EVA1CP58658 441 aa29.42■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.42■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.41■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.41■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
PRKRA-202ENST00000424699 NSD2O96028 1365 aa29.39■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 CRB1P82279 1406 aa29.38■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 HOXC9P31274 260 aa29.38■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 ERBB3P21860 1342 aa29.37■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.37■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 IP6K1Q92551 441 aa29.36■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 AMPHP49418 695 aa29.35■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.34■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 ANKRD24Q8TF21 1146 aa29.34■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.33■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 RTL1A6NKG5 1358 aa29.33■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
PRKRA-202ENST00000424699 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.32■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 MORC1Q86VD1 984 aa29.32■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 POLKQ9UBT6 870 aa29.32■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 LRRC37A3O60309 1634 aa29.32■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.31■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 FLT4P35916 1363 aa29.3■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 A0A0G2JS52 829 aa29.3■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 MYT1Q01538 1121 aa29.3■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.28■■■□□ 2.28
PRKRA-202ENST00000424699 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
PRKRA-202ENST00000424699 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.25■■■□□ 2.27
PRKRA-202ENST00000424699 INSRP06213 1382 aa29.25■■■□□ 2.27
PRKRA-202ENST00000424699 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.25■■■□□ 2.27
PRKRA-202ENST00000424699 CARD10Q9BWT7 1032 aa29.23■■■□□ 2.27
PRKRA-202ENST00000424699 BARGINQ6ZT62 677 aa29.23■■■□□ 2.27
PRKRA-202ENST00000424699 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.23■■■□□ 2.27
PRKRA-202ENST00000424699 DISP2A7MBM2 1401 aa29.23■■■□□ 2.27
PRKRA-202ENST00000424699 FAM182BQ5T319 152 aa29.22■■■□□ 2.27
PRKRA-202ENST00000424699 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.21■■■□□ 2.27
PRKRA-202ENST00000424699 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.2■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.19■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 NBPF4Q96M43 638 aa29.19■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 SOCS7O14512 581 aa29.18■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.15■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 RGPD1P0DJD0 1748 aa29.15■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 MEGF6O75095 1541 aa29.15■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 SBF2Q86WG5 1849 aa29.15■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.14■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
PRKRA-202ENST00000424699 MTHFSP49914 203 aa29.12■■■□□ 2.25
PRKRA-202ENST00000424699 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
PRKRA-202ENST00000424699 TNS2Q63HR2 1409 aa29.09■■■□□ 2.25
PRKRA-202ENST00000424699 EYA1Q99502 592 aa29.09■■■□□ 2.25
PRKRA-202ENST00000424699 NCAPD2Q15021 1401 aa29.08■■■□□ 2.25
PRKRA-202ENST00000424699 IL2RBP14784 551 aa29.08■■■□□ 2.25
PRKRA-202ENST00000424699 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.07■■■□□ 2.24
PRKRA-202ENST00000424699 DDB1Q16531 1140 aa29.07■■■□□ 2.24
PRKRA-202ENST00000424699 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
PRKRA-202ENST00000424699 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.06■■■□□ 2.24
PRKRA-202ENST00000424699 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.06■■■□□ 2.24
PRKRA-202ENST00000424699 PPP2R1AP30153 589 aa29.05■■■□□ 2.24
PRKRA-202ENST00000424699 PDE3BQ13370 1112 aa29.04■■■□□ 2.24
PRKRA-202ENST00000424699 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PRKRA-202ENST00000424699 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.02■■■□□ 2.24
PRKRA-202ENST00000424699 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PRKRA-202ENST00000424699 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.01■■■□□ 2.23
PRKRA-202ENST00000424699 IL13P35225 146 aa29.01■■■□□ 2.23
PRKRA-202ENST00000424699 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.99■■■□□ 2.23
PRKRA-202ENST00000424699 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.99■■■□□ 2.23
PRKRA-202ENST00000424699 EXOC5O00471 708 aa28.98■■■□□ 2.23
PRKRA-202ENST00000424699 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.95■■■□□ 2.23
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