RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421609.5

CERS2-206, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CERS2, Length 738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-206ENST00000421609 TMC1Q8TDI8 760 aa36.19■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa36.19■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 LRRC37A3O60309 1634 aa36.17■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.17■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 SLC24A1O60721 1099 aa36.17■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 NINLQ9Y2I6 1382 aa36.16■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP36.16■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 TRIM37O94972 964 aa36.15■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa36.15■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 TERF2IPQ9NYB0 399 aa36.15■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 A0A1W2PP64 1363 aa36.15■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 SOX12O15370 315 aa36.14■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 PEAK1Q9H792 1746 aa36.14■■■■□ 3.38
CERS2-206ENST00000421609 LTN1O94822 1766 aa36.12■■■■□ 3.37
CERS2-206ENST00000421609 NME9Q86XW9 330 aa36.12■■■■□ 3.37
CERS2-206ENST00000421609 PARD3Q8TEW0 1356 aa36.11■■■■□ 3.37
CERS2-206ENST00000421609 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.1■■■■□ 3.37
CERS2-206ENST00000421609 CAMKK2Q96RR4 588 aa36.08■■■■□ 3.37
CERS2-206ENST00000421609 CARD10Q9BWT7 1032 aa36.08■■■■□ 3.37
CERS2-206ENST00000421609 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa36.08■■■■□ 3.37
CERS2-206ENST00000421609 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa36.08■■■■□ 3.37
CERS2-206ENST00000421609 OVOS2Q6IE36 1432 aa36.08■■■■□ 3.37
CERS2-206ENST00000421609 SBF2Q86WG5 1849 aa36.07■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 RREB1Q92766 1687 aa36.06■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 LRP5O75197 1615 aa36.05■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 USP47Q96K76 1375 aa36.05■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 APBA3O96018 575 aa36.04■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 DDB1Q16531 1140 aa36.04■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.03■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa36.02■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.02■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 CCDC7Q96M83 1385 aa36.02■■■■□ 3.36
CERS2-206ENST00000421609 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
CERS2-206ENST00000421609 ERBB3P21860 1342 aa35.99■■■■□ 3.35
CERS2-206ENST00000421609 NUP188Q5SRE5 1749 aa35.99■■■■□ 3.35
CERS2-206ENST00000421609 BCL9O00512 1426 aa35.99■■■■□ 3.35
CERS2-206ENST00000421609 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
CERS2-206ENST00000421609 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa35.98■■■■□ 3.35
CERS2-206ENST00000421609 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.97■■■■□ 3.35
CERS2-206ENST00000421609 TMF1P82094 1093 aa35.96■■■■□ 3.35
CERS2-206ENST00000421609 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
CERS2-206ENST00000421609 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
CERS2-206ENST00000421609 TNS2Q63HR2 1409 aa35.91■■■■□ 3.34
CERS2-206ENST00000421609 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
CERS2-206ENST00000421609 EXOC5O00471 708 aa35.86■■■■□ 3.33
CERS2-206ENST00000421609 CDCA8Q53HL2 280 aa35.86■■■■□ 3.33
CERS2-206ENST00000421609 ANKRD24Q8TF21 1146 aa35.86■■■■□ 3.33
CERS2-206ENST00000421609 COG3Q96JB2 828 aa35.86■■■■□ 3.33
CERS2-206ENST00000421609 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.86■■■■□ 3.33
CERS2-206ENST00000421609 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
CERS2-206ENST00000421609 IP6K1Q92551 441 aa35.85■■■■□ 3.33
CERS2-206ENST00000421609 NLRP2Q9NX02 1062 aa35.85■■■■□ 3.33
CERS2-206ENST00000421609 PLSCR1O15162 318 aa35.84■■■■□ 3.33
CERS2-206ENST00000421609 MYOM1P52179 1685 aa35.81■■■■□ 3.32
CERS2-206ENST00000421609 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.79■■■■□ 3.32
CERS2-206ENST00000421609 IL2RBP14784 551 aa35.79■■■■□ 3.32
CERS2-206ENST00000421609 NBPF14Q5TI25 921 aa35.79■■■■□ 3.32
CERS2-206ENST00000421609 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.79■■■■□ 3.32
CERS2-206ENST00000421609 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.78■■■■□ 3.32
CERS2-206ENST00000421609 NHSQ6T4R5 1651 aa35.77■■■■□ 3.32
CERS2-206ENST00000421609 FYB1O15117 783 aa35.76■■■■□ 3.32
CERS2-206ENST00000421609 HOXC9P31274 260 aa35.74■■■■□ 3.31
CERS2-206ENST00000421609 RTL1A6NKG5 1358 aa35.74■■■■□ 3.31
CERS2-206ENST00000421609 RGPD2P0DJD1 1756 aa35.71■■■■□ 3.31
CERS2-206ENST00000421609 FBLN1P23142 703 aa35.7■■■■□ 3.31
CERS2-206ENST00000421609 AMPHP49418 695 aa35.7■■■■□ 3.31
CERS2-206ENST00000421609 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.7■■■■□ 3.31
CERS2-206ENST00000421609 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.7■■■■□ 3.31
CERS2-206ENST00000421609 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
CERS2-206ENST00000421609 PROM2Q8N271 834 aa35.66■■■■□ 3.3
CERS2-206ENST00000421609 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.64■■■■□ 3.3
CERS2-206ENST00000421609 BTAF1O14981 1849 aa35.63■■■■□ 3.29
CERS2-206ENST00000421609 KCNQ2O43526 872 aa35.63■■■■□ 3.29
CERS2-206ENST00000421609 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
CERS2-206ENST00000421609 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.62■■■■□ 3.29
CERS2-206ENST00000421609 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
CERS2-206ENST00000421609 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.61■■■■□ 3.29
CERS2-206ENST00000421609 CASZ1Q86V15 1759 aa35.6■■■■□ 3.29
CERS2-206ENST00000421609 SHANK3Q9BYB0 1731 aa35.6■■■■□ 3.29
CERS2-206ENST00000421609 TXNRD1Q16881 649 aa35.59■■■■□ 3.29
CERS2-206ENST00000421609 ACSBG1Q96GR2 724 aa35.58■■■■□ 3.29
CERS2-206ENST00000421609 INSRP06213 1382 aa35.56■■■■□ 3.28
CERS2-206ENST00000421609 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
CERS2-206ENST00000421609 MEGF6O75095 1541 aa35.56■■■■□ 3.28
CERS2-206ENST00000421609 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
CERS2-206ENST00000421609 FLT4P35916 1363 aa35.55■■■■□ 3.28
CERS2-206ENST00000421609 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.54■■■■□ 3.28
CERS2-206ENST00000421609 NBPF6Q5VWK0 638 aa35.52■■■■□ 3.28
CERS2-206ENST00000421609 NBPF4Q96M43 638 aa35.52■■■■□ 3.28
CERS2-206ENST00000421609 PAPPAQ13219 1627 aa35.51■■■■□ 3.28
CERS2-206ENST00000421609 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.51■■■■□ 3.282e-6■■■■■ 26.9
CERS2-206ENST00000421609 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
CERS2-206ENST00000421609 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa35.5■■■■□ 3.27
CERS2-206ENST00000421609 SPON1Q9HCB6 807 aa35.5■■■■□ 3.27
CERS2-206ENST00000421609 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.9 ms