RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.65■□□□□ 0.1
SMIM25-201ENST00000421019 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
SMIM25-201ENST00000421019 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.65■□□□□ 0.1
SMIM25-201ENST00000421019 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.65■□□□□ 0.1
SMIM25-201ENST00000421019 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.65■□□□□ 0.1
SMIM25-201ENST00000421019 NINLQ9Y2I6 1382 aa15.64■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 BCL9O00512 1426 aa15.64■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 EXOC5O00471 708 aa15.63■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.63■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 SOX12O15370 315 aa15.62■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 PROM2Q8N271 834 aa15.62■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 QRICH2Q9H0J4 1663 aa15.61■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 PEAK1Q9H792 1746 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 TXNRD1Q16881 649 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 STK32BQ9NY57 414 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC7Q96M83 1385 aa15.6■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 COL18A1P39060 1754 aa15.59■□□□□ 0.09
SMIM25-201ENST00000421019 LRRC37A3O60309 1634 aa15.58■□□□□ 0.09
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SMIM25-201ENST00000421019 ZBTB7AO95365 584 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 NEUROD1Q13562 356 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.57■□□□□ 0.08
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SMIM25-201ENST00000421019 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.57■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 SLC15A2Q16348 729 aa15.56■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 USP31Q70CQ4 1352 aa15.55■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP15.55■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.55■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 SBF2Q86WG5 1849 aa15.54■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 PTGER2P43116 358 aa15.54■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.53■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 IL2RBP14784 551 aa15.53■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 NFAT5O94916 1531 aa15.53■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 ABCC6O95255 1503 aa15.53■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 TNS2Q63HR2 1409 aa15.52■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 ERBB3P21860 1342 aa15.52■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 MTFR1LQ9H019 292 aa15.52■□□□□ 0.08
SMIM25-201ENST00000421019 NME9Q86XW9 330 aa15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 TMC1Q8TDI8 760 aa15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 SYT17Q9BSW7 474 aa15.51■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.5■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 AKAP12Q02952 1782 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 CASZ1Q86V15 1759 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.49■□□□□ 0.07
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SMIM25-201ENST00000421019 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa15.49■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 TERF2IPQ9NYB0 399 aa15.49■□□□□ 0.07
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SMIM25-201ENST00000421019 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.48■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 RGPD5Q99666 1765 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 ARXQ96QS3 562 aa15.47■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 IP6K1Q92551 441 aa15.46■□□□□ 0.07
SMIM25-201ENST00000421019 CD163L1Q9NR16 1453 aa15.46■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.44■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.43■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.43■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 MON2Q7Z3U7 1717 aa15.43■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.42■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 MAP3K5Q99683 1374 aa15.42■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 SLC24A1O60721 1099 aa15.42■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF827Q17R98 1081 aa15.42■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 MYOM1P52179 1685 aa15.41■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 NHSQ6T4R5 1651 aa15.41■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 A0A1W2PP64 1363 aa15.41■□□□□ 0.06
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SMIM25-201ENST00000421019 COG3Q96JB2 828 aa15.41■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 USP54Q70EL1 1684 aa15.41■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 POLD1P28340 1107 aa15.4■□□□□ 0.06
SMIM25-201ENST00000421019 AMPHP49418 695 aa15.39■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 TONSLQ96HA7 1378 aa15.38■□□□□ 0.05
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SMIM25-201ENST00000421019 GPR162Q16538 588 aa15.38■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.38■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 MAP3K19Q56UN5 1328 aa15.38■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 HOXC9P31274 260 aa15.37■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 PAPPAQ13219 1627 aa15.36■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 TESK2Q96S53 571 aa15.36■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa15.36■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 LTN1O94822 1766 aa15.35■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.35■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 BTAF1O14981 1849 aa15.35■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.35■□□□□ 0.05
SMIM25-201ENST00000421019 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
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