RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.81□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 NR5A1Q13285 461 aa7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 SCARF1Q14162 830 aa7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 PNMA1Q8ND90 353 aa7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 WIPF1O43516 503 aa7.79□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa7.78□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERBB4Q15303 1308 aa7.78□□□□□ -1.16
RPS3AP9-201ENST00000417027 UPP2O95045 317 aa7.77□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 GMPRP36959 345 aa7.77□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERFEQ4G0M1 354 aa7.77□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 EPS8L1Q8TE68 723 aa7.77□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC10A4Q96EP9 437 aa7.77□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.77□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.77□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 H3BM21 787 aa7.76□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTK2Q05397 1052 aa7.76□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 BMP2P12643 396 aa7.75□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZBTB33Q86T24 672 aa7.75□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 MEIOBQ8N635 442 aa7.75□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 BANK1Q8NDB2 785 aa7.75□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.75□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.75□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.74□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.73□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 SOCS7O14512 581 aa7.72□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAN1A2O60476 641 aa7.72□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 CBLBQ13191 982 aa7.72□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADAM32Q8TC27 787 aa7.72□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 IRF7Q92985 503 aa7.72□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa7.72□□□□□ -1.17
RPS3AP9-201ENST00000417027 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.71□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 STK17AQ9UEE5 414 aa7.71□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.71□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 APBB1O00213 710 aa7.69□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 RAB15P59190 212 aa7.69□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.69□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.69□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.69□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.68□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.67□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZBBXA8MT70 800 aa7.67□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNRKQ9NRH2 765 aa7.67□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.67□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 PPFIA3O75145 1194 aa7.66□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZMYND15Q9H091 742 aa7.66□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.66□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.66□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 TTLL8A6PVC2 850 aa7.65□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q6ZVU0 165 aa7.65□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.65□□□□□ -1.18
RPS3AP9-201ENST00000417027 FBXO45P0C2W1 286 aa7.64□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 RELBQ01201 579 aa7.64□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRIM52Q96A61 297 aa7.64□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ESPNB1AK53 854 aa7.63□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPR37L1O60883 481 aa7.63□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 VSIG8P0DPA2 414 aa7.62□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 PTSQ03393 145 aa7.62□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 NR1H3Q13133 447 aa7.62□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARID3AQ99856 593 aa7.62□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.62□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.61□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPINT1O43278 529 aa7.61□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.61□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.61□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF592Q92610 1267 aa7.61□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.61□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.6□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADD1P35611 737 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.59□□□□□ -1.19
RPS3AP9-201ENST00000417027 LILRA1O75019 489 aa7.58□□□□□ -1.2
RPS3AP9-201ENST00000417027 KRT76Q01546 638 aa7.58□□□□□ -1.2
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC125Q86Z20 511 aa7.58□□□□□ -1.2
RPS3AP9-201ENST00000417027 CYLDQ9NQC7 956 aa7.58□□□□□ -1.2
RPS3AP9-201ENST00000417027 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms