RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416681.5

UPP1-204, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene UPP1, Length 864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-204ENST00000416681 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
UPP1-204ENST00000416681 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.63■■□□□ 1.69
UPP1-204ENST00000416681 USP35Q9P2H5 1018 aa25.63■■□□□ 1.69
UPP1-204ENST00000416681 LTN1O94822 1766 aa25.61■■□□□ 1.69
UPP1-204ENST00000416681 A0A0G2JS52 829 aa25.61■■□□□ 1.69
UPP1-204ENST00000416681 MYT1Q01538 1121 aa25.61■■□□□ 1.69
UPP1-204ENST00000416681 BARGINQ6ZT62 677 aa25.6■■□□□ 1.69
UPP1-204ENST00000416681 CRB1P82279 1406 aa25.6■■□□□ 1.69
UPP1-204ENST00000416681 ABCC6O95255 1503 aa25.58■■□□□ 1.69
UPP1-204ENST00000416681 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.58■■□□□ 1.69
UPP1-204ENST00000416681 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.58■■□□□ 1.69
UPP1-204ENST00000416681 FYB1O15117 783 aa25.57■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 FAM182BQ5T319 152 aa25.56■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.56■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 FBLN1P23142 703 aa25.55■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 COG3Q96JB2 828 aa25.53■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.53■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.53■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.52■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 CCDC125Q86Z20 511 aa25.52■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
UPP1-204ENST00000416681 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.51■■□□□ 1.67
UPP1-204ENST00000416681 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.51■■□□□ 1.67
UPP1-204ENST00000416681 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.49■■□□□ 1.67
UPP1-204ENST00000416681 ERBB3P21860 1342 aa25.48■■□□□ 1.67
UPP1-204ENST00000416681 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.48■■□□□ 1.67
UPP1-204ENST00000416681 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.48■■□□□ 1.67
UPP1-204ENST00000416681 LRRC37A3O60309 1634 aa25.46■■□□□ 1.67
UPP1-204ENST00000416681 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.46■■□□□ 1.67
UPP1-204ENST00000416681 IP6K1Q92551 441 aa25.46■■□□□ 1.67
UPP1-204ENST00000416681 DISP2A7MBM2 1401 aa25.46■■□□□ 1.67
UPP1-204ENST00000416681 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.44■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.44■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 HOXC9P31274 260 aa25.42■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 PDE3BQ13370 1112 aa25.42■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.41■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 PEAK1Q9H792 1746 aa25.41■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 CCDC7Q96M83 1385 aa25.41■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.4■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 PANK3Q9H999 370 aa25.39■■□□□ 1.66
UPP1-204ENST00000416681 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.39■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.38■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.37■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 AMPHP49418 695 aa25.37■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 DDB1Q16531 1140 aa25.37■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.37■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 RTL1A6NKG5 1358 aa25.36■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 TRIM37O94972 964 aa25.35■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 SBF2Q86WG5 1849 aa25.35■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.34■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
UPP1-204ENST00000416681 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.32■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.31■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.31■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 TNS2Q63HR2 1409 aa25.3■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 IL2RBP14784 551 aa25.3■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 BAG6P46379 1132 aa25.3■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 EXOC5O00471 708 aa25.29■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 INSRP06213 1382 aa25.29■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 FLT4P35916 1363 aa25.29■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.29■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 BCL9O00512 1426 aa25.28■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.27■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 NBPF4Q96M43 638 aa25.27■■□□□ 1.64
UPP1-204ENST00000416681 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.26■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.25■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 POLKQ9UBT6 870 aa25.25■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.24■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 APBA3O96018 575 aa25.24■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 MSH5O43196 834 aa25.23■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 MEGF6O75095 1541 aa25.22■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 NSD2O96028 1365 aa25.22■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.22■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.21■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
UPP1-204ENST00000416681 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
UPP1-204ENST00000416681 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
UPP1-204ENST00000416681 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.19■■□□□ 1.62
UPP1-204ENST00000416681 RREB1Q92766 1687 aa25.19■■□□□ 1.62
UPP1-204ENST00000416681 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UPP1-204ENST00000416681 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
UPP1-204ENST00000416681 NCAPD2Q15021 1401 aa25.17■■□□□ 1.62
UPP1-204ENST00000416681 KCNQ2O43526 872 aa25.16■■□□□ 1.62
UPP1-204ENST00000416681 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.15■■□□□ 1.62
UPP1-204ENST00000416681 MORC1Q86VD1 984 aa25.15■■□□□ 1.62
UPP1-204ENST00000416681 NHSQ6T4R5 1651 aa25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms