RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411355.1

RNU6-954P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 954, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-954P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-954P-201ENST00000411355 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-954P-201ENST00000411355 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-954P-201ENST00000411355 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
RNU6-954P-201ENST00000411355 MEIOBQ8N635 442 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-954P-201ENST00000411355 BMP2P12643 396 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 CBLBQ13191 982 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 ADAM32Q8TC27 787 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 ERBB4Q15303 1308 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 WIPF1O43516 503 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 RAB15P59190 212 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 PTK2Q05397 1052 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 H3BM21 787 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 MAN1A2O60476 641 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 UPP2O95045 317 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 GMPRP36959 345 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 GOPCQ9HD26 462 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 IRF7Q92985 503 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-954P-201ENST00000411355 PNMA1Q8ND90 353 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 RELBQ01201 579 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 NBPF20Q3BBV1 942 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 Q6ZVU0 165 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 TTLL8A6PVC2 850 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 FBXO45P0C2W1 286 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 SPINT1O43278 529 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 PPFIA3O75145 1194 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZBBXA8MT70 800 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 GPR37L1O60883 481 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 LILRA1O75019 489 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 PTSQ03393 145 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 CYLDQ9NQC7 956 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 STK17AQ9UEE5 414 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-954P-201ENST00000411355 ESPNB1AK53 854 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 VSIG8P0DPA2 414 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 SNRKQ9NRH2 765 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 ADH1AP07327 375 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 RNF217Q8TC41 542 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 BANK1Q8NDB2 785 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 SLC35F4A4IF30 521 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 PTGIRP43119 386 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 KRT76Q01546 638 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 NR1H3Q13133 447 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-954P-201ENST00000411355 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 SCTRP47872 440 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 CDC14CA4D256 554 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 MEN1O00255 615 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 RHOQP17081 205 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 ITGA6P23229 1130 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 ERVK-9P63128 1117 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.44□□□□□ -1.38
RNU6-954P-201ENST00000411355 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.44□□□□□ -1.38
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