RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ANKRD54-203ENST00000407117 USP54Q70EL1 1684 aa39.06■■■■□ 3.84
ANKRD54-203ENST00000407117 SOX12O15370 315 aa39.06■■■■□ 3.84
ANKRD54-203ENST00000407117 WDR17Q8IZU2 1322 aa39.06■■■■□ 3.84
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ANKRD54-203ENST00000407117 USP47Q96K76 1375 aa39.04■■■■□ 3.84
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ANKRD54-203ENST00000407117 MYOM1P52179 1685 aa38.59■■■■□ 3.77
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ANKRD54-203ENST00000407117 FLT4P35916 1363 aa38.43■■■■□ 3.74
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ANKRD54-203ENST00000407117 ACSBG1Q96GR2 724 aa38.4■■■■□ 3.74
ANKRD54-203ENST00000407117 POLR3GLQ9BT43 218 aa38.39■■■■□ 3.74
ANKRD54-203ENST00000407117 TXNRD1Q16881 649 aa38.38■■■■□ 3.73
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ANKRD54-203ENST00000407117 NBPF4Q96M43 638 aa38.37■■■■□ 3.73
ANKRD54-203ENST00000407117 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa38.36■■■■□ 3.73
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ANKRD54-203ENST00000407117 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
ANKRD54-203ENST00000407117 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
ANKRD54-203ENST00000407117 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa38.31■■■■□ 3.72
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ANKRD54-203ENST00000407117 USHBP1Q8N6Y0 703 aa38.27■■■■□ 3.72
ANKRD54-203ENST00000407117 BTAF1O14981 1849 aa38.26■■■■□ 3.71
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