RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
PKDCC-202ENST00000401498 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.18
PKDCC-202ENST00000401498 ABCC6O95255 1503 aa41.12■■■■■ 4.17
PKDCC-202ENST00000401498 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa41.11■■■■■ 4.17
PKDCC-202ENST00000401498 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP41.11■■■■■ 4.17
PKDCC-202ENST00000401498 MORC1Q86VD1 984 aa41.11■■■■■ 4.17
PKDCC-202ENST00000401498 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP41.1■■■■■ 4.17
PKDCC-202ENST00000401498 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
PKDCC-202ENST00000401498 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
PKDCC-202ENST00000401498 STRN4Q9NRL3 753 aa41.09■■■■■ 4.17
PKDCC-202ENST00000401498 VPS72Q15906 364 aa41.08■■■■■ 4.17
PKDCC-202ENST00000401498 EVA1CP58658 441 aa41.06■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 IP6K1Q92551 441 aa41.06■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 AMPHP49418 695 aa41.04■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 PEAK1Q9H792 1746 aa41.04■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa41.03■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 HOXC9P31274 260 aa41.03■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 RXRBP28702 533 aa41.02■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 POLKQ9UBT6 870 aa41.01■■■■■ 4.16
PKDCC-202ENST00000401498 GLI3P10071 1580 aa41■■■■■ 4.15
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
PKDCC-202ENST00000401498 RTL1A6NKG5 1358 aa41■■■■■ 4.15
PKDCC-202ENST00000401498 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
PKDCC-202ENST00000401498 KIF24Q5T7B8 1368 aa40.98■■■■■ 4.15
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa40.97■■■■■ 4.15
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa40.97■■■■■ 4.15
PKDCC-202ENST00000401498 WDR17Q8IZU2 1322 aa40.96■■■■■ 4.15
PKDCC-202ENST00000401498 FLT4P35916 1363 aa40.96■■■■■ 4.15
PKDCC-202ENST00000401498 ERBB3P21860 1342 aa40.95■■■■■ 4.15
PKDCC-202ENST00000401498 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa40.94■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa40.93■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD24Q8TF21 1146 aa40.93■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 CRB1P82279 1406 aa40.92■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa40.91■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa40.9■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 INSRP06213 1382 aa40.9■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 ILDR2Q71H61 639 aa40.89■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 USP35Q9P2H5 1018 aa40.89■■■■■ 4.14
PKDCC-202ENST00000401498 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
PKDCC-202ENST00000401498 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP40.82■■■■■ 4.13
PKDCC-202ENST00000401498 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
PKDCC-202ENST00000401498 CARD10Q9BWT7 1032 aa40.82■■■■■ 4.13
PKDCC-202ENST00000401498 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
PKDCC-202ENST00000401498 RGS12O14924 1447 aa40.82■■■■■ 4.13
PKDCC-202ENST00000401498 RGPD2P0DJD1 1756 aa40.82■■■■■ 4.13
PKDCC-202ENST00000401498 TCP11L2Q8N4U5 519 aa40.82■■■■■ 4.12
PKDCC-202ENST00000401498 NLRP2Q9NX02 1062 aa40.81■■■■■ 4.12
PKDCC-202ENST00000401498 MTHFSP49914 203 aa40.8■■■■■ 4.12
PKDCC-202ENST00000401498 PARD3Q8TEW0 1356 aa40.79■■■■■ 4.12
PKDCC-202ENST00000401498 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
PKDCC-202ENST00000401498 BARGINQ6ZT62 677 aa40.78■■■■■ 4.12
PKDCC-202ENST00000401498 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa40.74■■■■■ 4.11
PKDCC-202ENST00000401498 PPP2R1AP30153 589 aa40.74■■■■■ 4.11
PKDCC-202ENST00000401498 SEPT12Q8IYM1 358 aa40.74■■■■■ 4.11
PKDCC-202ENST00000401498 NBPF6Q5VWK0 638 aa40.73■■■■■ 4.11
PKDCC-202ENST00000401498 NBPF4Q96M43 638 aa40.73■■■■■ 4.11
PKDCC-202ENST00000401498 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
PKDCC-202ENST00000401498 WNK3Q9BYP7 1800 aa40.71■■■■■ 4.11
PKDCC-202ENST00000401498 BRWD3Q6RI45 1802 aa40.7■■■■■ 4.11
PKDCC-202ENST00000401498 A0A0G2JS52 829 aa40.68■■■■■ 4.1
PKDCC-202ENST00000401498 MYT1Q01538 1121 aa40.68■■■■■ 4.1
PKDCC-202ENST00000401498 RALBP1Q15311 655 aa40.68■■■■■ 4.1
PKDCC-202ENST00000401498 DISP2A7MBM2 1401 aa40.66■■■■■ 4.1
PKDCC-202ENST00000401498 USHBP1Q8N6Y0 703 aa40.65■■■■■ 4.1
PKDCC-202ENST00000401498 EYA1Q99502 592 aa40.64■■■■■ 4.1
PKDCC-202ENST00000401498 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
PKDCC-202ENST00000401498 IL13P35225 146 aa40.61■■■■■ 4.09
PKDCC-202ENST00000401498 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
PKDCC-202ENST00000401498 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
PKDCC-202ENST00000401498 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
PKDCC-202ENST00000401498 NCAPD2Q15021 1401 aa40.59■■■■■ 4.09
PKDCC-202ENST00000401498 IL2RBP14784 551 aa40.58■■■■■ 4.09
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC37A3O60309 1634 aa40.57■■■■■ 4.08
PKDCC-202ENST00000401498 RGPD1P0DJD0 1748 aa40.56■■■■■ 4.08
PKDCC-202ENST00000401498 IGSF1Q8N6C5 1336 aa40.55■■■■■ 4.08
PKDCC-202ENST00000401498 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
PKDCC-202ENST00000401498 KRT27Q7Z3Y8 459 aa40.53■■■■■ 4.08
PKDCC-202ENST00000401498 CFAP53Q96M91 514 aa40.52■■■■■ 4.08
PKDCC-202ENST00000401498 MEGF6O75095 1541 aa40.52■■■■■ 4.08
PKDCC-202ENST00000401498 DDB1Q16531 1140 aa40.52■■■■■ 4.08
PKDCC-202ENST00000401498 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP40.51■■■■■ 4.08
PKDCC-202ENST00000401498 EP400Q96L91 3159 aa40.5■■■■■ 4.07
PKDCC-202ENST00000401498 PDE3BQ13370 1112 aa40.48■■■■■ 4.07
PKDCC-202ENST00000401498 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa40.48■■■■■ 4.07
PKDCC-202ENST00000401498 EXOC5O00471 708 aa40.47■■■■■ 4.07
PKDCC-202ENST00000401498 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa40.45■■■■■ 4.07
PKDCC-202ENST00000401498 TNS2Q63HR2 1409 aa40.45■■■■■ 4.07
PKDCC-202ENST00000401498 FAM182BQ5T319 152 aa40.44■■■■■ 4.06
PKDCC-202ENST00000401498 AEBP1Q8IUX7 1158 aa40.44■■■■■ 4.06
PKDCC-202ENST00000401498 TATP17735 454 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
PKDCC-202ENST00000401498 SULT6B1Q6IMI4 303 aa40.42■■■■■ 4.06
PKDCC-202ENST00000401498 KDRP35968 1356 aa40.41■■■■■ 4.06
PKDCC-202ENST00000401498 SHANK3Q9BYB0 1731 aa40.39■■■■■ 4.06
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