RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394765.7

UBXN6-202, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-202ENST00000394765 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
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UBXN6-202ENST00000394765 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.86■■□□□ 1.41
UBXN6-202ENST00000394765 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
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UBXN6-202ENST00000394765 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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UBXN6-202ENST00000394765 SLIT2O94813 1529 aa23.47■■□□□ 1.35
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UBXN6-202ENST00000394765 CCDC27Q2M243 656 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN6-202ENST00000394765 MCM10Q7L590 875 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN6-202ENST00000394765 CRB1P82279 1406 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN6-202ENST00000394765 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN6-202ENST00000394765 GOLGA2Q08379 1002 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN6-202ENST00000394765 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
UBXN6-202ENST00000394765 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.43■■□□□ 1.34
UBXN6-202ENST00000394765 NRAPQ86VF7 1730 aa23.43■■□□□ 1.34
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