RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394106.6

CMTM4-202, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,187 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-202ENST00000394106 RGPD5Q99666 1765 aa42.84■■■■■ 4.45
CMTM4-202ENST00000394106 EP400Q96L91 3159 aa42.83■■■■■ 4.45
CMTM4-202ENST00000394106 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa42.82■■■■■ 4.45
CMTM4-202ENST00000394106 CRB1P82279 1406 aa42.82■■■■■ 4.45
CMTM4-202ENST00000394106 OVOS2Q6IE36 1432 aa42.82■■■■■ 4.45
CMTM4-202ENST00000394106 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
CMTM4-202ENST00000394106 BARGINQ6ZT62 677 aa42.81■■■■■ 4.44
CMTM4-202ENST00000394106 MYOM1P52179 1685 aa42.8■■■■■ 4.44
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC125Q86Z20 511 aa42.8■■■■■ 4.44
CMTM4-202ENST00000394106 LTN1O94822 1766 aa42.78■■■■■ 4.44
CMTM4-202ENST00000394106 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa42.78■■■■■ 4.44
CMTM4-202ENST00000394106 POLR3GLQ9BT43 218 aa42.77■■■■■ 4.44
CMTM4-202ENST00000394106 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
CMTM4-202ENST00000394106 FAM182BQ5T319 152 aa42.76■■■■■ 4.44
CMTM4-202ENST00000394106 COG3Q96JB2 828 aa42.76■■■■■ 4.44
CMTM4-202ENST00000394106 WDR17Q8IZU2 1322 aa42.75■■■■■ 4.43
CMTM4-202ENST00000394106 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP42.75■■■■■ 4.43
CMTM4-202ENST00000394106 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa42.75■■■■■ 4.43
CMTM4-202ENST00000394106 ABCC6O95255 1503 aa42.74■■■■■ 4.43
CMTM4-202ENST00000394106 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
CMTM4-202ENST00000394106 GGNBP2Q9H3C7 697 aa42.67■■■■■ 4.42
CMTM4-202ENST00000394106 FYB1O15117 783 aa42.66■■■■■ 4.42
CMTM4-202ENST00000394106 PDE3BQ13370 1112 aa42.66■■■■■ 4.42
CMTM4-202ENST00000394106 KIF20BQ96Q89 1820 aa42.65■■■■■ 4.42
CMTM4-202ENST00000394106 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
CMTM4-202ENST00000394106 CARD14Q9BXL6 1004 aa42.64■■■■■ 4.42
CMTM4-202ENST00000394106 NSD3Q9BZ95 1437 aa42.63■■■■■ 4.41
CMTM4-202ENST00000394106 CARD10Q9BWT7 1032 aa42.62■■■■■ 4.41
CMTM4-202ENST00000394106 WNK3Q9BYP7 1800 aa42.6■■■■■ 4.41
CMTM4-202ENST00000394106 FBLN1P23142 703 aa42.6■■■■■ 4.41
CMTM4-202ENST00000394106 ERBB3P21860 1342 aa42.59■■■■■ 4.41
CMTM4-202ENST00000394106 DEFB132Q7Z7B7 95 aa42.58■■■■■ 4.41
CMTM4-202ENST00000394106 FAM196AQ6ZSG2 479 aa42.57■■■■■ 4.41
CMTM4-202ENST00000394106 ANKRD24Q8TF21 1146 aa42.57■■■■■ 4.41
CMTM4-202ENST00000394106 MAP3K19Q56UN5 1328 aa42.56■■■■■ 4.4
CMTM4-202ENST00000394106 LRRC37A3O60309 1634 aa42.56■■■■■ 4.4
CMTM4-202ENST00000394106 RGPD1P0DJD0 1748 aa42.55■■■■■ 4.4
CMTM4-202ENST00000394106 IP6K1Q92551 441 aa42.55■■■■■ 4.4
CMTM4-202ENST00000394106 NLRP2Q9NX02 1062 aa42.55■■■■■ 4.4
CMTM4-202ENST00000394106 CCDC7Q96M83 1385 aa42.53■■■■■ 4.4
CMTM4-202ENST00000394106 AMPHP49418 695 aa42.52■■■■■ 4.4
CMTM4-202ENST00000394106 DDB1Q16531 1140 aa42.52■■■■■ 4.4
CMTM4-202ENST00000394106 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
CMTM4-202ENST00000394106 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
CMTM4-202ENST00000394106 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
CMTM4-202ENST00000394106 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
CMTM4-202ENST00000394106 TRIM37O94972 964 aa42.48■■■■■ 4.39
CMTM4-202ENST00000394106 BAG6P46379 1132 aa42.48■■■■■ 4.39
CMTM4-202ENST00000394106 HOXC9P31274 260 aa42.47■■■■■ 4.39
CMTM4-202ENST00000394106 DISP2A7MBM2 1401 aa42.46■■■■■ 4.39
CMTM4-202ENST00000394106 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
CMTM4-202ENST00000394106 CGNL1Q0VF96 1302 aa42.46■■■■■ 4.39
CMTM4-202ENST00000394106 RTL1A6NKG5 1358 aa42.41■■■■■ 4.38
CMTM4-202ENST00000394106 PANK3Q9H999 370 aa42.41■■■■■ 4.38
CMTM4-202ENST00000394106 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
CMTM4-202ENST00000394106 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa42.4■■■■■ 4.38
CMTM4-202ENST00000394106 PEAK1Q9H792 1746 aa42.38■■■■■ 4.38
CMTM4-202ENST00000394106 EXOC5O00471 708 aa42.38■■■■■ 4.37
CMTM4-202ENST00000394106 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
CMTM4-202ENST00000394106 IL2RBP14784 551 aa42.36■■■■■ 4.37
CMTM4-202ENST00000394106 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP42.35■■■■■ 4.37
CMTM4-202ENST00000394106 APBA3O96018 575 aa42.33■■■■■ 4.37
CMTM4-202ENST00000394106 TNS2Q63HR2 1409 aa42.33■■■■■ 4.37
CMTM4-202ENST00000394106 RGPD2P0DJD1 1756 aa42.32■■■■■ 4.37
CMTM4-202ENST00000394106 KIF7Q2M1P5 1343 aa42.32■■■■■ 4.37
CMTM4-202ENST00000394106 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa42.29■■■■■ 4.36
CMTM4-202ENST00000394106 FLT4P35916 1363 aa42.29■■■■■ 4.36
CMTM4-202ENST00000394106 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa42.29■■■■■ 4.36
CMTM4-202ENST00000394106 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa42.28■■■■■ 4.36
CMTM4-202ENST00000394106 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
CMTM4-202ENST00000394106 SBF2Q86WG5 1849 aa42.27■■■■■ 4.36
CMTM4-202ENST00000394106 KIF24Q5T7B8 1368 aa42.26■■■■■ 4.35
CMTM4-202ENST00000394106 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
CMTM4-202ENST00000394106 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
CMTM4-202ENST00000394106 INSRP06213 1382 aa42.25■■■■■ 4.35
CMTM4-202ENST00000394106 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP42.23■■■■■ 4.35
CMTM4-202ENST00000394106 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP42.23■■■■■ 4.35
CMTM4-202ENST00000394106 CAMKK2Q96RR4 588 aa42.21■■■■■ 4.35
CMTM4-202ENST00000394106 NBPF6Q5VWK0 638 aa42.2■■■■■ 4.35
CMTM4-202ENST00000394106 NBPF4Q96M43 638 aa42.2■■■■■ 4.35
CMTM4-202ENST00000394106 BCL9O00512 1426 aa42.2■■■■■ 4.35
CMTM4-202ENST00000394106 USHBP1Q8N6Y0 703 aa42.18■■■■■ 4.34
CMTM4-202ENST00000394106 KNSTRNQ9Y448 316 aa42.18■■■■■ 4.34
CMTM4-202ENST00000394106 NSD2O96028 1365 aa42.17■■■■■ 4.34
CMTM4-202ENST00000394106 PTF1AQ7RTS3 328 aa42.16■■■■■ 4.34
CMTM4-202ENST00000394106 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
CMTM4-202ENST00000394106 POLKQ9UBT6 870 aa42.15■■■■■ 4.34
CMTM4-202ENST00000394106 PARD3Q8TEW0 1356 aa42.14■■■■■ 4.34
CMTM4-202ENST00000394106 MEGF6O75095 1541 aa42.12■■■■■ 4.33
CMTM4-202ENST00000394106 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
CMTM4-202ENST00000394106 MORC1Q86VD1 984 aa42.1■■■■■ 4.33
CMTM4-202ENST00000394106 WASHC2AQ641Q2 1341 aa42.1■■■■■ 4.33
CMTM4-202ENST00000394106 RREB1Q92766 1687 aa42.09■■■■■ 4.33
CMTM4-202ENST00000394106 ACSBG1Q96GR2 724 aa42.08■■■■■ 4.33
CMTM4-202ENST00000394106 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
CMTM4-202ENST00000394106 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa42.07■■■■■ 4.33
CMTM4-202ENST00000394106 KCNQ2O43526 872 aa42.05■■■■■ 4.32
CMTM4-202ENST00000394106 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
CMTM4-202ENST00000394106 NHSQ6T4R5 1651 aa42.05■■■■■ 4.32
CMTM4-202ENST00000394106 NUP188Q5SRE5 1749 aa42.03■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms