RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 CRB1P82279 1406 aa22.91■■□□□ 1.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 BARGINQ6ZT62 677 aa22.9■■□□□ 1.26
NME1-NME2-202ENST00000393193 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.88■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 LRRC37A3O60309 1634 aa22.88■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 PEAK1Q9H792 1746 aa22.86■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDCA8Q53HL2 280 aa22.86■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.85■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGPD1P0DJD0 1748 aa22.85■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 EVA1CP58658 441 aa22.84■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.84■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 DISP2A7MBM2 1401 aa22.83■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 SOX12O15370 315 aa22.83■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC125Q86Z20 511 aa22.83■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.83■■□□□ 1.25
NME1-NME2-202ENST00000393193 FYB1O15117 783 aa22.81■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 SBF2Q86WG5 1849 aa22.8■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.8■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP35Q9P2H5 1018 aa22.8■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.79■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 ERBB3P21860 1342 aa22.79■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.78■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.77■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 A0A0G2JS52 829 aa22.77■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYT1Q01538 1121 aa22.77■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM182BQ5T319 152 aa22.77■■□□□ 1.24
NME1-NME2-202ENST00000393193 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.76■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 COG3Q96JB2 828 aa22.75■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.75■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBLN1P23142 703 aa22.74■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.74■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 IP6K1Q92551 441 aa22.73■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.73■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC7Q96M83 1385 aa22.73■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.71■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 RTL1A6NKG5 1358 aa22.71■■□□□ 1.23
NME1-NME2-202ENST00000393193 BCL9O00512 1426 aa22.7■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 RREB1Q92766 1687 aa22.69■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.69■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.68■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNS2Q63HR2 1409 aa22.68■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 HOXC9P31274 260 aa22.68■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANKRD24Q8TF21 1146 aa22.68■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.67■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.66■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.66■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.65■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 PDE3BQ13370 1112 aa22.65■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NME1-NME2-202ENST00000393193 DDB1Q16531 1140 aa22.64■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.63■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.62■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.62■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIM37O94972 964 aa22.61■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 PANK3Q9H999 370 aa22.61■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 NLRP2Q9NX02 1062 aa22.61■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 NHSQ6T4R5 1651 aa22.61■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 INSRP06213 1382 aa22.61■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 FLT4P35916 1363 aa22.61■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 NCAPD2Q15021 1401 aa22.6■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 BAG6P46379 1132 aa22.59■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 AMPHP49418 695 aa22.59■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.59■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 MEGF6O75095 1541 aa22.58■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 IL2RBP14784 551 aa22.58■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.58■■□□□ 1.21
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.57■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.57■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 NSD2O96028 1365 aa22.56■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.56■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.56■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.55■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 NBPF4Q96M43 638 aa22.55■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 EXOC5O00471 708 aa22.54■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa22.54■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.54■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 POLKQ9UBT6 870 aa22.53■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.52■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 BTAF1O14981 1849 aa22.52■■□□□ 1.2
NME1-NME2-202ENST00000393193 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
NME1-NME2-202ENST00000393193 APBA3O96018 575 aa22.51■■□□□ 1.19
NME1-NME2-202ENST00000393193 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NME1-NME2-202ENST00000393193 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NME1-NME2-202ENST00000393193 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.5■■□□□ 1.19
NME1-NME2-202ENST00000393193 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.3 ms