RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 RGPD1P0DJD0 1748 aa37.88■■■■□ 3.65
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GNPTAB-202ENST00000392919 RGPD5Q99666 1765 aa37.88■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 A0A1W2PP64 1363 aa37.87■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 USP31Q70CQ4 1352 aa37.86■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 BAG6P46379 1132 aa37.86■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 CDCA8Q53HL2 280 aa37.85■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 PDE3BQ13370 1112 aa37.84■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa37.84■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 USP54Q70EL1 1684 aa37.83■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM196AQ6ZSG2 479 aa37.83■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 TERF2IPQ9NYB0 399 aa37.83■■■■□ 3.65
GNPTAB-202ENST00000392919 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
GNPTAB-202ENST00000392919 WDR17Q8IZU2 1322 aa37.82■■■■□ 3.64
GNPTAB-202ENST00000392919 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
GNPTAB-202ENST00000392919 TRIM37O94972 964 aa37.81■■■■□ 3.64
GNPTAB-202ENST00000392919 NINLQ9Y2I6 1382 aa37.8■■■■□ 3.64
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC37A3O60309 1634 aa37.73■■■■□ 3.63
GNPTAB-202ENST00000392919 DISP2A7MBM2 1401 aa37.73■■■■□ 3.63
GNPTAB-202ENST00000392919 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
GNPTAB-202ENST00000392919 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa37.73■■■■□ 3.63
GNPTAB-202ENST00000392919 WNK3Q9BYP7 1800 aa37.72■■■■□ 3.63
GNPTAB-202ENST00000392919 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa37.71■■■■□ 3.63
GNPTAB-202ENST00000392919 OVOS2Q6IE36 1432 aa37.71■■■■□ 3.63
GNPTAB-202ENST00000392919 LTN1O94822 1766 aa37.71■■■■□ 3.63
GNPTAB-202ENST00000392919 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
GNPTAB-202ENST00000392919 ABCC6O95255 1503 aa37.7■■■■□ 3.63
GNPTAB-202ENST00000392919 CARD10Q9BWT7 1032 aa37.69■■■■□ 3.62
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa37.68■■■■□ 3.62
GNPTAB-202ENST00000392919 APBA3O96018 575 aa37.67■■■■□ 3.62
GNPTAB-202ENST00000392919 DDB1Q16531 1140 aa37.67■■■■□ 3.62
GNPTAB-202ENST00000392919 POLR3GLQ9BT43 218 aa37.67■■■■□ 3.62
GNPTAB-202ENST00000392919 CAMKK2Q96RR4 588 aa37.66■■■■□ 3.62
GNPTAB-202ENST00000392919 PEAK1Q9H792 1746 aa37.66■■■■□ 3.62
GNPTAB-202ENST00000392919 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
GNPTAB-202ENST00000392919 MYOM1P52179 1685 aa37.64■■■■□ 3.62
GNPTAB-202ENST00000392919 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.62■■■■□ 3.61
GNPTAB-202ENST00000392919 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa37.61■■■■□ 3.61
GNPTAB-202ENST00000392919 ERBB3P21860 1342 aa37.61■■■■□ 3.61
GNPTAB-202ENST00000392919 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
GNPTAB-202ENST00000392919 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa37.6■■■■□ 3.61
GNPTAB-202ENST00000392919 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
GNPTAB-202ENST00000392919 CCDC7Q96M83 1385 aa37.58■■■■□ 3.61
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF7Q2M1P5 1343 aa37.58■■■■□ 3.61
GNPTAB-202ENST00000392919 FBLN1P23142 703 aa37.57■■■■□ 3.6
GNPTAB-202ENST00000392919 ANKRD24Q8TF21 1146 aa37.56■■■■□ 3.6
GNPTAB-202ENST00000392919 COG3Q96JB2 828 aa37.56■■■■□ 3.6
GNPTAB-202ENST00000392919 NLRP2Q9NX02 1062 aa37.56■■■■□ 3.6
GNPTAB-202ENST00000392919 SBF2Q86WG5 1849 aa37.56■■■■□ 3.6
GNPTAB-202ENST00000392919 CARD14Q9BXL6 1004 aa37.54■■■■□ 3.6
GNPTAB-202ENST00000392919 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
GNPTAB-202ENST00000392919 PTF1AQ7RTS3 328 aa37.53■■■■□ 3.6
GNPTAB-202ENST00000392919 RREB1Q92766 1687 aa37.52■■■■□ 3.6
GNPTAB-202ENST00000392919 IP6K1Q92551 441 aa37.51■■■■□ 3.6
GNPTAB-202ENST00000392919 PARD3Q8TEW0 1356 aa37.51■■■■□ 3.59
GNPTAB-202ENST00000392919 EXOC5O00471 708 aa37.5■■■■□ 3.59
GNPTAB-202ENST00000392919 FYB1O15117 783 aa37.5■■■■□ 3.59
GNPTAB-202ENST00000392919 GGNBP2Q9H3C7 697 aa37.49■■■■□ 3.59
GNPTAB-202ENST00000392919 MAP3K19Q56UN5 1328 aa37.49■■■■□ 3.59
GNPTAB-202ENST00000392919 NUP188Q5SRE5 1749 aa37.47■■■■□ 3.59
GNPTAB-202ENST00000392919 WASHC2AQ641Q2 1341 aa37.46■■■■□ 3.59
GNPTAB-202ENST00000392919 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
GNPTAB-202ENST00000392919 TNS2Q63HR2 1409 aa37.45■■■■□ 3.59
GNPTAB-202ENST00000392919 NSD3Q9BZ95 1437 aa37.44■■■■□ 3.58
GNPTAB-202ENST00000392919 PANK3Q9H999 370 aa37.44■■■■□ 3.58
GNPTAB-202ENST00000392919 BCL9O00512 1426 aa37.44■■■■□ 3.58
GNPTAB-202ENST00000392919 IL2RBP14784 551 aa37.43■■■■□ 3.58
GNPTAB-202ENST00000392919 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
GNPTAB-202ENST00000392919 HOXC9P31274 260 aa37.42■■■■□ 3.58
GNPTAB-202ENST00000392919 LRP5O75197 1615 aa37.4■■■■□ 3.58
GNPTAB-202ENST00000392919 AMPHP49418 695 aa37.4■■■■□ 3.58
GNPTAB-202ENST00000392919 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
GNPTAB-202ENST00000392919 KIF20BQ96Q89 1820 aa37.4■■■■□ 3.58
GNPTAB-202ENST00000392919 PLSCR1O15162 318 aa37.36■■■■□ 3.57
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
GNPTAB-202ENST00000392919 RGPD2P0DJD1 1756 aa37.35■■■■□ 3.57
GNPTAB-202ENST00000392919 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
GNPTAB-202ENST00000392919 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa37.34■■■■□ 3.57
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNQ2O43526 872 aa37.34■■■■□ 3.57
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF14Q5TI25 921 aa37.32■■■■□ 3.56
GNPTAB-202ENST00000392919 ACSBG1Q96GR2 724 aa37.31■■■■□ 3.56
GNPTAB-202ENST00000392919 PROM2Q8N271 834 aa37.3■■■■□ 3.56
GNPTAB-202ENST00000392919 CGNL1Q0VF96 1302 aa37.3■■■■□ 3.56
GNPTAB-202ENST00000392919 RTL1A6NKG5 1358 aa37.29■■■■□ 3.56
GNPTAB-202ENST00000392919 NHSQ6T4R5 1651 aa37.27■■■■□ 3.56
GNPTAB-202ENST00000392919 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa37.23■■■■□ 3.55
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF6Q5VWK0 638 aa37.23■■■■□ 3.55
GNPTAB-202ENST00000392919 NBPF4Q96M43 638 aa37.23■■■■□ 3.55
GNPTAB-202ENST00000392919 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP37.23■■■■□ 3.55
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP37.22■■■■□ 3.55
GNPTAB-202ENST00000392919 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
GNPTAB-202ENST00000392919 USHBP1Q8N6Y0 703 aa37.21■■■■□ 3.55
GNPTAB-202ENST00000392919 MEGF6O75095 1541 aa37.2■■■■□ 3.55
GNPTAB-202ENST00000392919 TXNRD1Q16881 649 aa37.2■■■■□ 3.55
GNPTAB-202ENST00000392919 KNSTRNQ9Y448 316 aa37.2■■■■□ 3.55
GNPTAB-202ENST00000392919 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa37.19■■■■□ 3.54
GNPTAB-202ENST00000392919 INSRP06213 1382 aa37.18■■■■□ 3.54
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