RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.07■□□□□ 0.96
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PGGT1B-202ENST00000379615 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.05■□□□□ 0.96
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCC6O95255 1503 aa21.04■□□□□ 0.96
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PGGT1B-202ENST00000379615 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.03■□□□□ 0.96
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PGGT1B-202ENST00000379615 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.99■□□□□ 0.95
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PGGT1B-202ENST00000379615 LTN1O94822 1766 aa20.97■□□□□ 0.95
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.97■□□□□ 0.95
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PGGT1B-202ENST00000379615 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.96■□□□□ 0.95
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PGGT1B-202ENST00000379615 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.95■□□□□ 0.94
PGGT1B-202ENST00000379615 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PGGT1B-202ENST00000379615 FLT4P35916 1363 aa20.95■□□□□ 0.94
PGGT1B-202ENST00000379615 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.95■□□□□ 0.94
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PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.92■□□□□ 0.94
PGGT1B-202ENST00000379615 RGPD5Q99666 1765 aa20.92■□□□□ 0.94
PGGT1B-202ENST00000379615 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PGGT1B-202ENST00000379615 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.92■□□□□ 0.94
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PGGT1B-202ENST00000379615 EP400Q96L91 3159 aa20.88■□□□□ 0.93
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC125Q86Z20 511 aa20.88■□□□□ 0.93
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM182BQ5T319 152 aa20.87■□□□□ 0.93
PGGT1B-202ENST00000379615 IL2RBP14784 551 aa20.85■□□□□ 0.93
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PGGT1B-202ENST00000379615 DDB1Q16531 1140 aa20.85■□□□□ 0.93
PGGT1B-202ENST00000379615 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.84■□□□□ 0.93
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOC5O00471 708 aa20.84■□□□□ 0.93
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PGGT1B-202ENST00000379615 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PGGT1B-202ENST00000379615 NBPF6Q5VWK0 638 aa20.82■□□□□ 0.92
PGGT1B-202ENST00000379615 NBPF4Q96M43 638 aa20.82■□□□□ 0.92
PGGT1B-202ENST00000379615 PEAK1Q9H792 1746 aa20.81■□□□□ 0.92
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.81■□□□□ 0.92
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PGGT1B-202ENST00000379615 MTHFSP49914 203 aa20.8■□□□□ 0.92
PGGT1B-202ENST00000379615 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.8■□□□□ 0.92
PGGT1B-202ENST00000379615 DISP2A7MBM2 1401 aa20.79■□□□□ 0.92
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PGGT1B-202ENST00000379615 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PGGT1B-202ENST00000379615 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
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PGGT1B-202ENST00000379615 USHBP1Q8N6Y0 703 aa20.76■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP53Q96M91 514 aa20.75■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 TNS2Q63HR2 1409 aa20.73■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.73■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.72■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP2R1AP30153 589 aa20.72■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 BAG6P46379 1132 aa20.72■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 RALBP1Q15311 655 aa20.72■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 IL13P35225 146 aa20.71■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 RGPD2P0DJD1 1756 aa20.71■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.71■□□□□ 0.91
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC37A3O60309 1634 aa20.71■□□□□ 0.91
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