RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 TMC1Q8TDI8 760 aa24.92■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.92■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.92■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 NFAT5O94916 1531 aa24.91■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 USP54Q70EL1 1684 aa24.91■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 USP31Q70CQ4 1352 aa24.91■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.91■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 LRP5O75197 1615 aa24.9■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.89■■□□□ 1.58
SYP-202ENST00000376303 ABCC6O95255 1503 aa24.89■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 LRRC37A3O60309 1634 aa24.89■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 DDB1Q16531 1140 aa24.88■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.88■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.87■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.87■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.87■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 SLC24A1O60721 1099 aa24.87■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 PEAK1Q9H792 1746 aa24.86■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 SBF2Q86WG5 1849 aa24.86■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.86■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 CARD10Q9BWT7 1032 aa24.86■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 RREB1Q92766 1687 aa24.85■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 NME9Q86XW9 330 aa24.85■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 LTN1O94822 1766 aa24.85■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.84■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 TESK2Q96S53 571 aa24.84■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 A0A1W2PP64 1363 aa24.83■■□□□ 1.57
SYP-202ENST00000376303 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.82■■□□□ 1.56
SYP-202ENST00000376303 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.81■■□□□ 1.56
SYP-202ENST00000376303 CCDC7Q96M83 1385 aa24.8■■□□□ 1.56
SYP-202ENST00000376303 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SYP-202ENST00000376303 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.78■■□□□ 1.56
SYP-202ENST00000376303 BCL9O00512 1426 aa24.78■■□□□ 1.56
SYP-202ENST00000376303 NBPF14Q5TI25 921 aa24.77■■□□□ 1.56
SYP-202ENST00000376303 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SYP-202ENST00000376303 ERBB3P21860 1342 aa24.77■■□□□ 1.56
SYP-202ENST00000376303 EXOC5O00471 708 aa24.76■■□□□ 1.55
SYP-202ENST00000376303 PLSCR1O15162 318 aa24.75■■□□□ 1.55
SYP-202ENST00000376303 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SYP-202ENST00000376303 USP47Q96K76 1375 aa24.72■■□□□ 1.55
SYP-202ENST00000376303 NLRP2Q9NX02 1062 aa24.72■■□□□ 1.55
SYP-202ENST00000376303 TNS2Q63HR2 1409 aa24.71■■□□□ 1.55
SYP-202ENST00000376303 TMF1P82094 1093 aa24.71■■□□□ 1.55
SYP-202ENST00000376303 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.71■■□□□ 1.55
SYP-202ENST00000376303 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.69■■□□□ 1.54
SYP-202ENST00000376303 COG3Q96JB2 828 aa24.69■■□□□ 1.54
SYP-202ENST00000376303 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.68■■□□□ 1.54
SYP-202ENST00000376303 IL2RBP14784 551 aa24.68■■□□□ 1.54
SYP-202ENST00000376303 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.68■■□□□ 1.54
SYP-202ENST00000376303 IP6K1Q92551 441 aa24.68■■□□□ 1.54
SYP-202ENST00000376303 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.68■■□□□ 1.54
SYP-202ENST00000376303 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SYP-202ENST00000376303 CDCA8Q53HL2 280 aa24.65■■□□□ 1.54
SYP-202ENST00000376303 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.64■■□□□ 1.54
SYP-202ENST00000376303 NHSQ6T4R5 1651 aa24.62■■□□□ 1.53
SYP-202ENST00000376303 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.61■■□□□ 1.53
SYP-202ENST00000376303 PROM2Q8N271 834 aa24.61■■□□□ 1.53
SYP-202ENST00000376303 AMPHP49418 695 aa24.6■■□□□ 1.53
SYP-202ENST00000376303 FYB1O15117 783 aa24.59■■□□□ 1.53
SYP-202ENST00000376303 HOXC9P31274 260 aa24.59■■□□□ 1.53
SYP-202ENST00000376303 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
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SYP-202ENST00000376303 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.57■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 FBLN1P23142 703 aa24.57■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 TXNRD1Q16881 649 aa24.57■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.57■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.57■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 SPON1Q9HCB6 807 aa24.57■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.57■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.56■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 RTL1A6NKG5 1358 aa24.55■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 BTAF1O14981 1849 aa24.55■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 CASZ1Q86V15 1759 aa24.54■■□□□ 1.52
SYP-202ENST00000376303 MYOM1P52179 1685 aa24.53■■□□□ 1.52
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SYP-202ENST00000376303 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SYP-202ENST00000376303 STK32BQ9NY57 414 aa24.51■■□□□ 1.51
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SYP-202ENST00000376303 SLC15A2Q16348 729 aa24.49■■□□□ 1.51
SYP-202ENST00000376303 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SYP-202ENST00000376303 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.47■■□□□ 1.51
SYP-202ENST00000376303 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.47■■□□□ 1.51
SYP-202ENST00000376303 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.47■■□□□ 1.51
SYP-202ENST00000376303 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
SYP-202ENST00000376303 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.45■■□□□ 1.51
SYP-202ENST00000376303 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.45■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 NBPF4Q96M43 638 aa24.45■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 MEGF6O75095 1541 aa24.45■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 INSRP06213 1382 aa24.44■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 FLT4P35916 1363 aa24.44■■□□□ 1.5
SYP-202ENST00000376303 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.44■■□□□ 1.5
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