RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNH5Q8NCM2 988 aa27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTF1AQ7RTS3 328 aa27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARHGEF25Q86VW2 580 aa27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRC37A3O60309 1634 aa27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC3-204ENST00000373166 BCL9O00512 1426 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 PROM2Q8N271 834 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 EXOC5O00471 708 aa27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 SOX12O15370 315 aa27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEUROD1Q13562 356 aa27.4■■□□□ 1.98
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TRAPPC3-204ENST00000373166 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL18A1P39060 1754 aa27.39■■□□□ 1.98
TRAPPC3-204ENST00000373166 PIK3C2AO00443 1686 aa27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC3-204ENST00000373166 TTC21AQ8NDW8 1320 aa27.39■■□□□ 1.97
TRAPPC3-204ENST00000373166 TXNRD1Q16881 649 aa27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3-204ENST00000373166 STK32BQ9NY57 414 aa27.38■■□□□ 1.97
TRAPPC3-204ENST00000373166 SBF2Q86WG5 1849 aa27.37■■□□□ 1.97
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC7Q96M83 1385 aa27.35■■□□□ 1.97
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TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC15A2Q16348 729 aa27.34■■□□□ 1.97
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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TRAPPC3-204ENST00000373166 MTFR1LQ9H019 292 aa27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNS2Q63HR2 1409 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3-204ENST00000373166 AKAP12Q02952 1782 aa27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC3-204ENST00000373166 NFAT5O94916 1531 aa27.26■■□□□ 1.96
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYT17Q9BSW7 474 aa27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 TONSLQ96HA7 1378 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 ABCC6O95255 1503 aa27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 ACSBG1Q96GR2 724 aa27.24■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 UTRNP46939 3433 aa27.23■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERBB3P21860 1342 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYOM1P52179 1685 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 RGPD5Q99666 1765 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP31Q70CQ4 1352 aa27.22■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 IL2RBP14784 551 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3-204ENST00000373166 NME9Q86XW9 330 aa27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARXQ96QS3 562 aa27.18■■□□□ 1.94
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TRAPPC3-204ENST00000373166 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3-204ENST00000373166 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMC1Q8TDI8 760 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3-204ENST00000373166 MON2Q7Z3U7 1717 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF827Q17R98 1081 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP3K5Q99683 1374 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.08■■□□□ 1.93
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TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 PAPPAQ13219 1627 aa27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP54Q70EL1 1684 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR162Q16538 588 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 IP6K1Q92551 441 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 AKT1S1Q96B36 256 aa27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 POLD1P28340 1107 aa27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC3-204ENST00000373166 BTAF1O14981 1849 aa27.02■■□□□ 1.92
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TRAPPC3-204ENST00000373166 A0A1W2PP64 1363 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC3-204ENST00000373166 LTN1O94822 1766 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC3-204ENST00000373166 C1QTNF8P60827 252 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC3-204ENST00000373166 KLHL34Q8N239 644 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC3-204ENST00000373166 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
TRAPPC3-204ENST00000373166 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27■■□□□ 1.91
TRAPPC3-204ENST00000373166 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3-204ENST00000373166 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3-204ENST00000373166 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3-204ENST00000373166 COG3Q96JB2 828 aa26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNQ4P56696 695 aa26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3-204ENST00000373166 AMPHP49418 695 aa26.93■■□□□ 1.9
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