RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 PEAK1Q9H792 1746 aa25.4■■□□□ 1.66
TRAPPC3-202ENST00000373162 A0A0G2JS52 829 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3-202ENST00000373162 EVA1CP58658 441 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYT1Q01538 1121 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3-202ENST00000373162 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.39■■□□□ 1.66
TRAPPC3-202ENST00000373162 SLC24A1O60721 1099 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM182BQ5T319 152 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 LTN1O94822 1766 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYOM1P52179 1685 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMC1Q8TDI8 760 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.37■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 USP35Q9P2H5 1018 aa25.36■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.35■■□□□ 1.65
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.3■■□□□ 1.64
TRAPPC3-202ENST00000373162 SOX12O15370 315 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3-202ENST00000373162 TMF1P82094 1093 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM196AQ6ZSG2 479 aa25.29■■□□□ 1.64
TRAPPC3-202ENST00000373162 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3-202ENST00000373162 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3-202ENST00000373162 SBF2Q86WG5 1849 aa25.28■■□□□ 1.64
TRAPPC3-202ENST00000373162 RREB1Q92766 1687 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3-202ENST00000373162 ERBB3P21860 1342 aa25.27■■□□□ 1.64
TRAPPC3-202ENST00000373162 BAG6P46379 1132 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.26■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 BCL9O00512 1426 aa25.25■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC7Q96M83 1385 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 PDE3BQ13370 1112 aa25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRIM37O94972 964 aa25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 TNS2Q63HR2 1409 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 FYB1O15117 783 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 DDB1Q16531 1140 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDCA8Q53HL2 280 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 IP6K1Q92551 441 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRP5O75197 1615 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 COG3Q96JB2 828 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-202ENST00000373162 FBLN1P23142 703 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 RTL1A6NKG5 1358 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 APBA3O96018 575 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 HOXC9P31274 260 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 NHSQ6T4R5 1651 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAPPC3-202ENST00000373162 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAPPC3-202ENST00000373162 EXOC5O00471 708 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-202ENST00000373162 IL2RBP14784 551 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-202ENST00000373162 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-202ENST00000373162 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAPPC3-202ENST00000373162 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLSCR1O15162 318 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-202ENST00000373162 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAPPC3-202ENST00000373162 MEGF6O75095 1541 aa25.02■■□□□ 1.6
TRAPPC3-202ENST00000373162 INSRP06213 1382 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3-202ENST00000373162 NCAPD2Q15021 1401 aa25.01■■□□□ 1.59
TRAPPC3-202ENST00000373162 AMPHP49418 695 aa25■■□□□ 1.59
TRAPPC3-202ENST00000373162 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TRAPPC3-202ENST00000373162 FLT4P35916 1363 aa24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC3-202ENST00000373162 PROM2Q8N271 834 aa24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3-202ENST00000373162 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC3-202ENST00000373162 BTAF1O14981 1849 aa24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC3-202ENST00000373162 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC3-202ENST00000373162 NBPF4Q96M43 638 aa24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC3-202ENST00000373162 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3-202ENST00000373162 PAPPAQ13219 1627 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3-202ENST00000373162 KCNQ2O43526 872 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3-202ENST00000373162 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3-202ENST00000373162 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3-202ENST00000373162 CASZ1Q86V15 1759 aa24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC3-202ENST00000373162 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3-202ENST00000373162 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC3-202ENST00000373162 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC3-202ENST00000373162 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.9■■□□□ 1.58
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