RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 IQGAP1P46940 1657 aa13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYOM1P52179 1685 aa13.22□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 FEZ1Q99689 392 aa13.21□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa13.21□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 INSRP06213 1382 aa13.21□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC39Q9UFE4 941 aa13.21□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 TERF2Q15554 542 aa13.21□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 SYNMO15061 1565 aa13.2□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 ERVK-7P63135 1459 aa13.2□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 RARSP54136 660 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 GPATCH11Q8N954 259 aa13.2□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 NSD3Q9BZ95 1437 aa13.2□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 MTHFSP49914 203 aa13.2□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 CGNL1Q0VF96 1302 aa13.19□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLXNC1O60486 1568 aa13.19□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 TOMM22Q9NS69 142 aa13.19□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 RBM25P49756 843 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLCH2O75038 1416 aa13.18□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 NINLQ9Y2I6 1382 aa13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.38e-7■■□□□ 13
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APOBEC3C-201ENST00000361441 IRF6O14896 467 aa13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 PHF14O94880 888 aa13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSCBQ8IWL3 235 aa13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMC4Q9NTJ3 1288 aa13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHD1O14646 1710 aa13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDE3AQ14432 1141 aa13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 STK26Q9P289 416 aa13.17□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNNT1P13805 278 aa13.16□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 NOP2P46087 812 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCC2Q92887 1545 aa13.16□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa13.16□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANKRD7Q92527 254 aa13.16□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP83Q9Y592 693 aa13.16□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 GYS2P54840 703 aa13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 GGT6Q6P531 493 aa13.15□□□□□ -0.3
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APOBEC3C-201ENST00000361441 NCAPGQ9BPX3 1015 aa13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 CEP152O94986 1710 aa13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 TRPM2O94759 1503 aa13.15□□□□□ -0.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCC1P33527 1531 aa13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 KLHL40Q2TBA0 621 aa13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 CABP2Q9NPB3 220 aa13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 NOS1P29475 1434 aa13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLASP1Q7Z460 1538 aa13.14□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa13.13□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOLGA6L22H0YM25 854 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC172P0C7W6 258 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 RAB3GAP1Q15042 981 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF214Q8ND24 703 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 C22orf23Q9BZE7 217 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 CTNNA3Q9UI47 895 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 KANK1Q14678 1352 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCA6Q8N139 1617 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLSTN1O94985 981 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF445P59923 1031 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 ITPRIPQ8IWB1 547 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF592Q92610 1267 aa13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 FBLN1P23142 703 aa13.11□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDIT3P35638 169 aa13.11□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 ICE2Q659A1 982 aa13.11□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLCD4Q9BRC7 762 aa13.11□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 GGNBP2Q9H3C7 697 aa13.11□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa13.11□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 RASSF4Q9H2L5 321 aa13.11□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOLIM4O00461 696 aa13.1□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 SEMA3FQ13275 785 aa13.1□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF217Q8TC41 542 aa13.1□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIBF1Q8WXW3 757 aa13.1□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa13.1□□□□□ -0.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 PTPRTO14522 1441 aa13.1□□□□□ -0.31
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