RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0G2JS52 829 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYT1Q01538 1121 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 AXIN2Q9Y2T1 843 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF20BQ96Q89 1820 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRB1P82279 1406 aa27.26■■□□□ 1.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP35Q9P2H5 1018 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 WNK3Q9BYP7 1800 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 BARGINQ6ZT62 677 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR17Q8IZU2 1322 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 COG3Q96JB2 828 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 FYB1O15117 783 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC37A3O60309 1634 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC125Q86Z20 511 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERBB3P21860 1342 aa27.14■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM182BQ5T319 152 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGPD1P0DJD0 1748 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARD10Q9BWT7 1032 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP3K19Q56UN5 1328 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 DISP2A7MBM2 1401 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBLN1P23142 703 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 IP6K1Q92551 441 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC7Q96M83 1385 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD24Q8TF21 1146 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTL1A6NKG5 1358 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 PEAK1Q9H792 1746 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE3BQ13370 1112 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXC9P31274 260 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM196AQ6ZSG2 479 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB132Q7Z7B7 95 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGPD2P0DJD1 1756 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMPHP49418 695 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDB1Q16531 1140 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 PANK3Q9H999 370 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNS2Q63HR2 1409 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 SBF2Q86WG5 1849 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 FLT4P35916 1363 aa26.96■■□□□ 1.91
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM37O94972 964 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 BAG6P46379 1132 aa26.94■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 INSRP06213 1382 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL2RBP14784 551 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 NSD2O96028 1365 aa26.92■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL9O00512 1426 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOC5O00471 708 aa26.9■■□□□ 1.9
PTPRCAP-201ENST00000326294 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.87■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEGF6O75095 1541 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 RREB1Q92766 1687 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.86■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF6Q5VWK0 638 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF4Q96M43 638 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 APBA3O96018 575 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLKQ9UBT6 870 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 NHSQ6T4R5 1651 aa26.83■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.82■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCAPD2Q15021 1401 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PTPRCAP-201ENST00000326294 MORC1Q86VD1 984 aa26.77■■□□□ 1.88
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