RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318561.7

SFTPC-201, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFTPC, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-201ENST00000318561 AKAP12Q02952 1782 aa23.65■■□□□ 1.38
SFTPC-201ENST00000318561 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa23.64■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 EVA1CP58658 441 aa23.63■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 CDCA8Q53HL2 280 aa23.63■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 SSH2Q76I76 1423 aa23.63■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.62■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 TMC1Q8TDI8 760 aa23.62■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 PLSCR1O15162 318 aa23.61■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 USP6P35125 1406 aa23.59■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.58■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 PROM2Q8N271 834 aa23.58■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.58■■□□□ 1.37
SFTPC-201ENST00000318561 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.57■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.55■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.55■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.55■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.55■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 CHD4Q14839 1912 aa23.53■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.53■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.53■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.53■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 MTFR1LQ9H019 292 aa23.52■■□□□ 1.36
SFTPC-201ENST00000318561 ABTB2Q8N961 1025 aa23.51■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 STK32BQ9NY57 414 aa23.51■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 A0A1W2PP64 1363 aa23.51■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.5■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 GPR162Q16538 588 aa23.5■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.5■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 SLC15A2Q16348 729 aa23.49■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 ARXQ96QS3 562 aa23.49■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.49■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.49■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.49■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 PIK3C2AO00443 1686 aa23.48■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 PEAK1Q9H792 1746 aa23.47■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 NLRP13Q86W25 1043 aa23.46■■□□□ 1.35
SFTPC-201ENST00000318561 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 TXNRD1Q16881 649 aa23.45■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 MAP3K5Q99683 1374 aa23.44■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 NLRP6P59044 892 aa23.44■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 USP19O94966 1318 aa23.43■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 DDB1Q16531 1140 aa23.42■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.41■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 CPDO75976 1380 aa23.41■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.4■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.39■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 USP54Q70EL1 1684 aa23.39■■□□□ 1.34
SFTPC-201ENST00000318561 SLIT3O75094 1523 aa23.38■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 NME9Q86XW9 330 aa23.38■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 CRB1P82279 1406 aa23.38■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 USP31Q70CQ4 1352 aa23.38■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 SBF2Q86WG5 1849 aa23.38■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 LRRC37A3O60309 1634 aa23.37■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 GCP02774 474 aa23.36■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 KLHL34Q8N239 644 aa23.36■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.35■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.34■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 CCDC7Q96M83 1385 aa23.33■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 KCNH5Q8NCM2 988 aa23.33■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.33■■□□□ 1.33
SFTPC-201ENST00000318561 BCL9O00512 1426 aa23.33■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.32■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 HSPA6P17066 643 aa23.32■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 PANK3Q9H999 370 aa23.31■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.3■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.3■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 NFAT5O94916 1531 aa23.29■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 SOX12O15370 315 aa23.29■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.29■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 COG3Q96JB2 828 aa23.29■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 FYB1O15117 783 aa23.28■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.28■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 ATP10DQ9P241 1426 aa23.27■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 ZNF827Q17R98 1081 aa23.27■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.27■■□□□ 1.32
SFTPC-201ENST00000318561 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.26■■□□□ 1.31
SFTPC-201ENST00000318561 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
SFTPC-201ENST00000318561 LTN1O94822 1766 aa23.24■■□□□ 1.31
SFTPC-201ENST00000318561 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.24■■□□□ 1.31
SFTPC-201ENST00000318561 COL18A1P39060 1754 aa23.23■■□□□ 1.31
SFTPC-201ENST00000318561 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.22■■□□□ 1.31
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