RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 NME9Q86XW9 330 aa21.62■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 TMC1Q8TDI8 760 aa21.62■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 PDE3BQ13370 1112 aa21.61■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.6■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 WDR17Q8IZU2 1322 aa21.6■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 USP54Q70EL1 1684 aa21.6■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 A0A1W2PP64 1363 aa21.58■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.58■■□□□ 1.05
CTSW-201ENST00000307886 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 PEAK1Q9H792 1746 aa21.57■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 LRRC37A3O60309 1634 aa21.56■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 APBA3O96018 575 aa21.55■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.55■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 WNK3Q9BYP7 1800 aa21.55■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.55■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.52■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.52■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 ABCC6O95255 1503 aa21.52■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 SBF2Q86WG5 1849 aa21.52■■□□□ 1.04
CTSW-201ENST00000307886 DDB1Q16531 1140 aa21.52■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.51■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 LTN1O94822 1766 aa21.5■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.5■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 USP47Q96K76 1375 aa21.5■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.5■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 RREB1Q92766 1687 aa21.48■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 ERBB3P21860 1342 aa21.48■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.48■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 SLC24A1O60721 1099 aa21.48■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.47■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 FBLN1P23142 703 aa21.46■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.46■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.46■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 LRP5O75197 1615 aa21.46■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 BCL9O00512 1426 aa21.46■■□□□ 1.03
CTSW-201ENST00000307886 CCDC7Q96M83 1385 aa21.45■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.45■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.44■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 TMF1P82094 1093 aa21.44■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.44■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 EXOC5O00471 708 aa21.43■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 IP6K1Q92551 441 aa21.43■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.43■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 PLSCR1O15162 318 aa21.42■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.42■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 FYB1O15117 783 aa21.41■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 PROM2Q8N271 834 aa21.41■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.41■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 TNS2Q63HR2 1409 aa21.4■■□□□ 1.02
CTSW-201ENST00000307886 COG3Q96JB2 828 aa21.39■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.38■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.38■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 KCNQ2O43526 872 aa21.37■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 HOXC9P31274 260 aa21.37■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.37■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 IL2RBP14784 551 aa21.36■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 MYOM1P52179 1685 aa21.35■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.34■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 NBPF14Q5TI25 921 aa21.33■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
CTSW-201ENST00000307886 CDCA8Q53HL2 280 aa21.32■■□□□ 1
CTSW-201ENST00000307886 AMPHP49418 695 aa21.31■■□□□ 1
CTSW-201ENST00000307886 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CTSW-201ENST00000307886 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.3■■□□□ 1
CTSW-201ENST00000307886 NHSQ6T4R5 1651 aa21.3■■□□□ 1
CTSW-201ENST00000307886 TXNRD1Q16881 649 aa21.29■■□□□ 1
CTSW-201ENST00000307886 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.28■■□□□ 1
CTSW-201ENST00000307886 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
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CTSW-201ENST00000307886 NBPF4Q96M43 638 aa21.27■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 RTL1A6NKG5 1358 aa21.26■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.26■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.25■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.24■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 BTAF1O14981 1849 aa21.24■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.24■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 CASZ1Q86V15 1759 aa21.23■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 MEGF6O75095 1541 aa21.23■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 INSRP06213 1382 aa21.22■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.22■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.21■□□□□ 0.99
CTSW-201ENST00000307886 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CTSW-201ENST00000307886 SPON1Q9HCB6 807 aa21.2■□□□□ 0.98
CTSW-201ENST00000307886 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.2■□□□□ 0.98
CTSW-201ENST00000307886 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
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