RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288616.7

CABP1-201, Transcript of calcium binding protein 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CABP1, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1-201ENST00000288616 LRRC37A3O60309 1634 aa25.31■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.31■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 PEAK1Q9H792 1746 aa25.3■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 RGPD5Q99666 1765 aa25.3■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 SBF2Q86WG5 1849 aa25.3■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.3■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.29■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 SPON1Q9HCB6 807 aa25.29■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 KCNQ2O43526 872 aa25.27■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CABP1-201ENST00000288616 PLSCR1O15162 318 aa25.26■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 AKAP12Q02952 1782 aa25.26■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.24■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.24■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.24■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 EXOC5O00471 708 aa25.22■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 PROM2Q8N271 834 aa25.2■■□□□ 1.63
CABP1-201ENST00000288616 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 YY1P25490 414 aa25.18■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.18■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 NFAT5O94916 1531 aa25.18■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 TMC1Q8TDI8 760 aa25.18■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 NME9Q86XW9 330 aa25.17■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 ZBTB7AO95365 584 aa25.16■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 CCDC7Q96M83 1385 aa25.15■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.15■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 TXNRD1Q16881 649 aa25.15■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.15■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.15■■□□□ 1.62
CABP1-201ENST00000288616 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.13■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 BCL9O00512 1426 aa25.13■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.13■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 STK32BQ9NY57 414 aa25.13■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.12■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.12■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 CASZ1Q86V15 1759 aa25.11■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.11■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 USP31Q70CQ4 1352 aa25.1■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 ERBB3P21860 1342 aa25.09■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 TNS2Q63HR2 1409 aa25.09■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 SLC15A2Q16348 729 aa25.08■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.08■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.08■■□□□ 1.61
CABP1-201ENST00000288616 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.07■■□□□ 1.6
CABP1-201ENST00000288616 LTN1O94822 1766 aa25.07■■□□□ 1.6
CABP1-201ENST00000288616 IL2RBP14784 551 aa25.06■■□□□ 1.6
CABP1-201ENST00000288616 ABCC6O95255 1503 aa25.06■■□□□ 1.6
CABP1-201ENST00000288616 PTGER2P43116 358 aa25.04■■□□□ 1.6
CABP1-201ENST00000288616 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.03■■□□□ 1.6
CABP1-201ENST00000288616 MYOM1P52179 1685 aa25.02■■□□□ 1.6
CABP1-201ENST00000288616 NHSQ6T4R5 1651 aa25.02■■□□□ 1.6
CABP1-201ENST00000288616 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CABP1-201ENST00000288616 USP54Q70EL1 1684 aa25.01■■□□□ 1.6
CABP1-201ENST00000288616 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CABP1-201ENST00000288616 A0A1W2PP64 1363 aa25■■□□□ 1.59
CABP1-201ENST00000288616 TONSLQ96HA7 1378 aa25■■□□□ 1.59
CABP1-201ENST00000288616 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CABP1-201ENST00000288616 MTFR1LQ9H019 292 aa24.98■■□□□ 1.59
CABP1-201ENST00000288616 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CABP1-201ENST00000288616 BTAF1O14981 1849 aa24.97■■□□□ 1.59
CABP1-201ENST00000288616 IP6K1Q92551 441 aa24.95■■□□□ 1.59
CABP1-201ENST00000288616 SYT17Q9BSW7 474 aa24.95■■□□□ 1.59
CABP1-201ENST00000288616 FBLN1P23142 703 aa24.94■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 ZNF827Q17R98 1081 aa24.93■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.93■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.92■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 COG3Q96JB2 828 aa24.92■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.92■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 AMPHP49418 695 aa24.9■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 ARXQ96QS3 562 aa24.9■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 TESK2Q96S53 571 aa24.9■■□□□ 1.58
CABP1-201ENST00000288616 PAPPAQ13219 1627 aa24.89■■□□□ 1.57
CABP1-201ENST00000288616 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.89■■□□□ 1.57
CABP1-201ENST00000288616 KCNQ4P56696 695 aa24.88■■□□□ 1.57
CABP1-201ENST00000288616 HOXC9P31274 260 aa24.87■■□□□ 1.57
CABP1-201ENST00000288616 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CABP1-201ENST00000288616 KLHL34Q8N239 644 aa24.85■■□□□ 1.57
CABP1-201ENST00000288616 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.84■■□□□ 1.57
CABP1-201ENST00000288616 AKT1S1Q96B36 256 aa24.84■■□□□ 1.57
CABP1-201ENST00000288616 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CABP1-201ENST00000288616 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.83■■□□□ 1.57
CABP1-201ENST00000288616 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.8■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.8■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.8■■□□□ 1.56
CABP1-201ENST00000288616 UTRNP46939 3433 aa24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms