RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.61■■□□□ 1.37
IMP4-201ENST00000259239 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.61■■□□□ 1.37
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IMP4-201ENST00000259239 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-201ENST00000259239 TOM1O60784 492 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-201ENST00000259239 RUNDC1Q96C34 613 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-201ENST00000259239 APAF1O14727 1248 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-201ENST00000259239 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.58■■□□□ 1.37
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IMP4-201ENST00000259239 IP6K1Q92551 441 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-201ENST00000259239 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.56■■□□□ 1.36
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IMP4-201ENST00000259239 COL18A1P39060 1754 aa23.55■■□□□ 1.36
IMP4-201ENST00000259239 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
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IMP4-201ENST00000259239 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-201ENST00000259239 EYA1Q99502 592 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-201ENST00000259239 CPDO75976 1380 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-201ENST00000259239 NEUROD2Q15784 382 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-201ENST00000259239 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.48■■□□□ 1.35
IMP4-201ENST00000259239 ZNF521Q96K83 1311 aa23.47■■□□□ 1.35
IMP4-201ENST00000259239 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
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IMP4-201ENST00000259239 KDRP35968 1356 aa23.45■■□□□ 1.35
IMP4-201ENST00000259239 NEFMP07197 916 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-201ENST00000259239 CHRNA2Q15822 529 aa23.45■■□□□ 1.34
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IMP4-201ENST00000259239 NCAPD2Q15021 1401 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-201ENST00000259239 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.36■■□□□ 1.33
IMP4-201ENST00000259239 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
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IMP4-201ENST00000259239 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
IMP4-201ENST00000259239 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.33■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 SLFN5Q08AF3 891 aa23.33■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 FAM83GA6ND36 823 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 WDR63Q8IWG1 891 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.32■■□□□ 1.32
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IMP4-201ENST00000259239 E9PSI1 815 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.28■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 JCADQ9P266 1359 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-201ENST00000259239 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.27■■□□□ 1.32
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IMP4-201ENST00000259239 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
IMP4-201ENST00000259239 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
IMP4-201ENST00000259239 STRN4Q9NRL3 753 aa23.25■■□□□ 1.31
IMP4-201ENST00000259239 ADAMTS2O95450 1211 aa23.25■■□□□ 1.31
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IMP4-201ENST00000259239 MEGF6O75095 1541 aa23.24■■□□□ 1.31
IMP4-201ENST00000259239 NRAPQ86VF7 1730 aa23.24■■□□□ 1.31
IMP4-201ENST00000259239 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
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IMP4-201ENST00000259239 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-201ENST00000259239 IL16Q14005 1332 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-201ENST00000259239 LRRC37A3O60309 1634 aa23.23■■□□□ 1.31
IMP4-201ENST00000259239 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
IMP4-201ENST00000259239 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.22■■□□□ 1.31
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