RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 FSD1Q9BTV5 496 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 ERICH2A1L162 156 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 UVSSAQ2YD98 709 aa18.95■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 GNAI3P08754 354 aa18.94■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 CFAP45Q9UL16 551 aa18.94■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa18.94■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 HIP1O00291 1037 aa18.94■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 MAP9Q49MG5 647 aa18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 MNAT1P51948 309 aa18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 DNAAF4Q8WXU2 420 aa18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 TRIM34Q9BYJ4 488 aa18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 BAG4O95429 457 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 CAMK4Q16566 473 aa18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.93■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 C20orf194Q5TEA3 1177 aa18.92■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.92■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 TICAM2Q86XR7 235 aa18.92■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 CASQ1P31415 396 aa18.92■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.92■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 PPP6R1Q9UPN7 881 aa18.92■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.92■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 EPS15P42566 896 aa18.91■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 WDR63Q8IWG1 891 aa18.91■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 KIF21BO75037 1637 aa18.91■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 TEFQ10587 303 aa18.91■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 WWC1Q8IX03 1113 aa18.91■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 BRMS1Q9HCU9 246 aa18.91■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.91■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 SLFN5Q08AF3 891 aa18.9■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 HS1BP3Q53T59 392 aa18.9■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.9■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 MTHFSP49914 203 aa18.9■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 TBC1D32Q96NH3 1257 aa18.9■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 KIF20AO95235 890 aa18.9■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 XBP1P17861 261 aa18.9■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 CEP135Q66GS9 1140 aa18.9■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 MCM3P25205 808 aa18.89■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 STK3Q13188 491 aa18.89■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 CFAP100Q494V2 611 aa18.89■□□□□ 0.62
CTIF-201ENST00000256413 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 DDX58O95786 925 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 LRSAM1Q6UWE0 723 aa18.89■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 CTR9Q6PD62 1173 aa18.88■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 TAX1BP1Q86VP1 789 aa18.88■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 IVLP07476 585 aa18.88■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 HMOX1P09601 288 aa18.88■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 PDRG1Q9NUG6 133 aa18.88■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 POTEB2H3BUK9 544 aa18.87■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 ANO10Q9NW15 660 aa18.87■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 ATP2B1P20020 1258 aa18.87■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 GNAI2P04899 355 aa18.86■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 KIF5CO60282 957 aa18.86■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.86■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.86■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 GSDMDP57764 484 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 EVA1CP58658 441 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 WASHC4Q2M389 1173 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 IGSF3O75054 1194 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 FEZ1Q99689 392 aa18.85■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 NEFHP12036 1026 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 OGFRQ9NZT2 677 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 WIZO95785 1651 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 KDM4AO75164 1064 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.84■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
CTIF-201ENST00000256413 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 25.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 636 ms