RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.39■■□□□ 1.66
DUSP1-201ENST00000239223 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.39■■□□□ 1.66
DUSP1-201ENST00000239223 NEUROD2Q15784 382 aa25.39■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.38■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF521Q96K83 1311 aa25.38■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.38■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.37■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.37■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 PRKAR2BP31323 418 aa25.36■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 FCHSD2O94868 740 aa25.34■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.34■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.33■■□□□ 1.65
DUSP1-201ENST00000239223 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.33■■□□□ 1.64
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DUSP1-201ENST00000239223 RTL1A6NKG5 1358 aa25.32■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.32■■□□□ 1.64
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DUSP1-201ENST00000239223 IP6K1Q92551 441 aa25.31■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 ARHGEF10O15013 1369 aa25.3■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa25.3■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 EYA1Q99502 592 aa25.3■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.3■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 WWC1Q8IX03 1113 aa25.29■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
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DUSP1-201ENST00000239223 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.28■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 PDE3BQ13370 1112 aa25.27■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 ABCA3Q99758 1704 aa25.27■■□□□ 1.64
DUSP1-201ENST00000239223 IGSF1Q8N6C5 1336 aa25.26■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 GOLGA2Q08379 1002 aa25.25■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.25■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.24■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.24■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 COL18A1P39060 1754 aa25.24■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 CHRNA2Q15822 529 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 KDRP35968 1356 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 RIPK4P57078 832 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 PIP4K2BP78356 416 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 NGEFQ8N5V2 710 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 KIAA0232Q92628 1395 aa25.22■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 SLFN5Q08AF3 891 aa25.21■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.21■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 CCDC27Q2M243 656 aa25.2■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.2■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 NBPF4Q96M43 638 aa25.2■■□□□ 1.63
DUSP1-201ENST00000239223 NFE2L2Q16236 605 aa25.19■■□□□ 1.62
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DUSP1-201ENST00000239223 CPDO75976 1380 aa25.16■■□□□ 1.62
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DUSP1-201ENST00000239223 TOM1O60784 492 aa25.15■■□□□ 1.62
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DUSP1-201ENST00000239223 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
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DUSP1-201ENST00000239223 E9PSI1 815 aa25.13■■□□□ 1.61
DUSP1-201ENST00000239223 WDR63Q8IWG1 891 aa25.13■■□□□ 1.61
DUSP1-201ENST00000239223 FAM83GA6ND36 823 aa25.13■■□□□ 1.61
DUSP1-201ENST00000239223 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.12■■□□□ 1.61
DUSP1-201ENST00000239223 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
DUSP1-201ENST00000239223 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
DUSP1-201ENST00000239223 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
DUSP1-201ENST00000239223 DCTN1Q14203 1278 aa25.11■■□□□ 1.61
DUSP1-201ENST00000239223 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.11■■□□□ 1.61
DUSP1-201ENST00000239223 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.1■■□□□ 1.61
DUSP1-201ENST00000239223 NCAPD2Q15021 1401 aa25.09■■□□□ 1.61
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DUSP1-201ENST00000239223 ABCC6O95255 1503 aa25.08■■□□□ 1.61
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DUSP1-201ENST00000239223 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.08■■□□□ 1.61
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DUSP1-201ENST00000239223 MCM10Q7L590 875 aa25.04■■□□□ 1.6
DUSP1-201ENST00000239223 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.03■■□□□ 1.6
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DUSP1-201ENST00000239223 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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DUSP1-201ENST00000239223 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25■■□□□ 1.59
DUSP1-201ENST00000239223 MYH16Q9H6N6 1097 aa25■■□□□ 1.59
DUSP1-201ENST00000239223 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.99■■□□□ 1.59
DUSP1-201ENST00000239223 NEFLP07196 543 aa24.98■■□□□ 1.59
DUSP1-201ENST00000239223 MEGF6O75095 1541 aa24.98■■□□□ 1.59
DUSP1-201ENST00000239223 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.96■■□□□ 1.59
DUSP1-201ENST00000239223 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
DUSP1-201ENST00000239223 STRN4Q9NRL3 753 aa24.96■■□□□ 1.59
DUSP1-201ENST00000239223 PLIN1O60240 522 aa24.95■■□□□ 1.58
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