RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 OFD1O75665 1012 aa12.07□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 MAP3K11Q16584 847 aa12.07□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 STAC3Q96MF2 364 aa12.07□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 STK3Q13188 491 aa12.07□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L10A6NI86 522 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 PPFIBP1Q86W92 1011 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 SPATA32Q96LK8 384 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 SLFN5Q08AF3 891 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 G3V3G9 751 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 WWC1Q8IX03 1113 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 JMYQ8N9B5 988 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 XBP1P17861 261 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CCDC183Q5T5S1 534 aa12.06□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 VPS37DQ86XT2 251 aa12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 DYNC1I1O14576 645 aa12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CEP57L1Q8IYX8 460 aa12.05□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 FAM193AP78312 1265 aa12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 ATP2B1P20020 1258 aa12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 PTPRGP23470 1445 aa12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CBFA2T2O43439 604 aa12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 TMEM132EQ6IEE7 984 aa12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 TNNT1P13805 278 aa12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 UBXN4Q92575 508 aa12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 PTPN14Q15678 1187 aa12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CCT4P50991 539 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 SSFA2P28290 1259 aa12.03□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 ERC1Q8IUD2 1116 aa12.03□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 RAD21O60216 631 aa12.03□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.03□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 INCENPQ9NQS7 918 aa12.03□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CFAP45Q9UL16 551 aa12.03□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CCDC102AQ96A19 550 aa12.03□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa12.03□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 KIF18AQ8NI77 898 aa12.03□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 TMCO3Q6UWJ1 677 aa12.02□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CAMK4Q16566 473 aa12.02□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa12.02□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 PDRG1Q9NUG6 133 aa12.02□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 MCM5P33992 734 aa12.02□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 TXLNAP40222 546 aa12.02□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 DAPK1P53355 1430 aa12.02□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 NCOA1Q15788 1441 aa12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 TRIM34Q9BYJ4 488 aa12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 NAIPQ13075 1403 aa12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 SART3Q15020 963 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 SLC4A2P04920 1241 aa12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 CASTP20810 708 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 IQCEQ6IPM2 695 aa12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 ODF2Q5BJF6 829 aa12.01□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 ERLIN2O94905 339 aa12□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 DACH1Q9UI36 760 aa12□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa12□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 TIGD1Q96MW7 591 aa12□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 SPDYE4A6NLX3 237 aa12□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 CCDC181Q5TID7 509 aa12□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 FYB1O15117 783 aa11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 CLCN1P35523 988 aa11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 USP25Q9UHP3 1055 aa11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 PPP6R1Q9UPN7 881 aa11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 TICAM2Q86XR7 235 aa11.98□□□□□ -0.49
TTL-201ENST00000233336 STIM1Q13586 685 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms