RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 KLHL34Q8N239 644 aa15.89■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 USP19O94966 1318 aa15.88■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 PEAK1Q9H792 1746 aa15.88■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 CDK19Q9BWU1 502 aa15.87■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.86■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 LMO7Q8WWI1 1683 aa15.86■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 ADGRB1O14514 1584 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 BCL9O00512 1426 aa15.85■□□□□ 0.13
APOC3-201ENST00000227667 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.83■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 EXOC5O00471 708 aa15.82■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 POLD1P28340 1107 aa15.82■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.82■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.82■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 LRRC37A3O60309 1634 aa15.81■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 HSPA6P17066 643 aa15.81■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 SBF2Q86WG5 1849 aa15.81■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 WDR17Q8IZU2 1322 aa15.8■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 GRIN3BO60391 1043 aa15.8■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 NLRP6P59044 892 aa15.79■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 ZNF827Q17R98 1081 aa15.79■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.79■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.79■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 ITSN1Q15811 1721 aa15.78■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa15.78■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.78■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.78■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.77■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.77■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.77■□□□□ 0.12
APOC3-201ENST00000227667 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
APOC3-201ENST00000227667 ATP10DQ9P241 1426 aa15.76■□□□□ 0.11
APOC3-201ENST00000227667 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
APOC3-201ENST00000227667 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.74■□□□□ 0.11
APOC3-201ENST00000227667 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
APOC3-201ENST00000227667 AKT1S1Q96B36 256 aa15.72■□□□□ 0.11
APOC3-201ENST00000227667 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
APOC3-201ENST00000227667 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa15.71■□□□□ 0.11
APOC3-201ENST00000227667 STAC3Q96MF2 364 aa15.71■□□□□ 0.11
APOC3-201ENST00000227667 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.71■□□□□ 0.11
APOC3-201ENST00000227667 USP6P35125 1406 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 SOX12O15370 315 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 ARHGEF25Q86VW2 580 aa15.7■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 CABP2Q9NPB3 220 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 CCDC7Q96M83 1385 aa15.69■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 TNS2Q63HR2 1409 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 AKAP12Q02952 1782 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 KCNH5Q8NCM2 988 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 CABP1Q9NZU7 370 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 PAPPAQ13219 1627 aa15.68■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa15.67■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 SLIT3O75094 1523 aa15.67■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 MSH5O43196 834 aa15.66■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
APOC3-201ENST00000227667 CAPN15O75808 1086 aa15.64■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 APLP1P51693 650 aa15.64■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 KCNQ4P56696 695 aa15.64■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.64■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 NHSQ6T4R5 1651 aa15.63■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 COL18A1P39060 1754 aa15.63■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 IL2RBP14784 551 aa15.63■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 ADCY9O60503 1353 aa15.62■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.61■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 KIF3CO14782 793 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 MSL1Q68DK7 614 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 CD2APQ9Y5K6 639 aa15.6■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa15.59■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 ABCC6O95255 1503 aa15.58■□□□□ 0.09
APOC3-201ENST00000227667 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.58■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.57■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 BTAF1O14981 1849 aa15.57■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.57■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 ERBB3P21860 1342 aa15.56■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 PCNTO95613 3336 aa15.55■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.55■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 PIK3C2AO00443 1686 aa15.55■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.55■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 TTC21AQ8NDW8 1320 aa15.54■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 TOMM70O94826 608 aa15.54■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 TNS4Q8IZW8 715 aa15.54■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 ANKRD24Q8TF21 1146 aa15.54■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 PRELPP51888 382 aa15.53■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 RGPD5Q99666 1765 aa15.52■□□□□ 0.08
APOC3-201ENST00000227667 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms