RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000108593.7

Ctdnep1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctdnep1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 RgmbQ7TQ33 436 aa40,82■■■■■ 4,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q7TT23 1179 aa40,82■■■■■ 4,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 OptnQ8K3K8 584 aa40,82■■■■■ 4,13
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 CrklP47941 303 aa40,82■■■■■ 4,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Shank2Q80Z38 1476 aa40,82■■■■■ 4,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Dmrt2Q8BG36 561 aa40,82■■■■■ 4,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rsph6aQ8CDR2 708 aa40,82■■■■■ 4,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc12a5Q91V14 1138 aa40,81■■■■■ 4,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eno4Q8C042 619 aa40,79■■■■■ 4,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TkfcQ8VC30 578 aa40,77■■■■■ 4,12
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slit1Q80TR4 1531 aa40,75■■■■■ 4,11
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zfp777B9EKF4 885 aa40,75■■■■■ 4,11
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GsdmaQ9EST1 446 aa40,74■■■■■ 4,11
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plekhd1B2RPU2 505 aa40,71■■■■■ 4,11
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Atf7ipQ7TT18 1306 aa40,71■■■■■ 4,11
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ccdc129Q14B48 1034 aa40,71■■■■■ 4,11
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP40,71■■■■■ 4,11
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eya1P97767 591 aa40,69■■■■■ 4,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tsen2Q6P7W5 460 aa40,69■■■■■ 4,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Parp14Q2EMV9 1817 aa40,69■■■■■ 4,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Col15a1O35206 1367 aa40,68■■■■■ 4,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kdm6aO70546 1401 aa40,68■■■■■ 4,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mrs2Q5NCE8 434 aa40,67■■■■■ 4,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa40,65■■■■■ 4,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pm20d1Q8C165 503 aa40,64■■■■■ 4,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Pak3Q61036 559 aa40,64■■■■■ 4,1
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 FocadA2AKG8 1798 aa40,63■■■■■ 4,09
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zpr1Q62384 459 aa40,6■■■■■ 4,09
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP40,6■■■■■ 4,09
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 PalmQ9Z0P4 383 aa40,6■■■■■ 4,09
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 MpripP97434 1024 aa40,6■■■■■ 4,09
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zscan21Q07231 555 aa40,6■■■■■ 4,09
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Zranb3Q6NZP1 1069 aa40,6■■■■■ 4,09
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP40,59■■■■■ 4,09
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Simc1E9Q6E9 1354 aa40,56■■■■■ 4,08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm10471E9Q1C7 252 aa40,56■■■■■ 4,08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cacna1sQ02789 1880 aa40,53■■■■■ 4,08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa40,53■■■■■ 4,08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fer1l6E0CZ42 1862 aa40,52■■■■■ 4,08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 GapdhsQ64467 440 aa40,52■■■■■ 4,08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa40,52■■■■■ 4,08
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fchsd2Q3USJ8 740 aa40,47■■■■■ 4,07
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cc2d1aQ8K1A6 943 aa40,47■■■■■ 4,07
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Spef2Q8C9J3 1734 aa40,46■■■■■ 4,07
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP40,45■■■■■ 4,07
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Akap11E9Q777 1895 aa40,44■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 NrdcQ8BHG1 1161 aa40,44■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kat6bQ8BRB7 1872 aa40,44■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ltbp1Q8CG19 1712 aa40,43■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa40,43■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Aplp2Q06335 707 aa40,42■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Vps33bP59016 617 aa40,42■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TnikP83510 1323 aa40,41■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ginm1Q91WR6 327 aa40,41■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 ThemisQ8BGW0 636 aa40,4■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mst1rQ62190 1378 aa40,39■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mcm10Q0VBD2 885 aa40,38■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa40,38■■■■■ 4,06
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Plin1Q8CGN5 517 aa40,38■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 HypkQ9CR41 129 aa40,38■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Adgrb1Q3UHD1 1582 aa40,36■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ankrd23Q812A3 306 aa40,36■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Stk31Q99MW1 1018 aa40,36■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP40,35■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP40,35■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Esx1O88933 382 aa40,34■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP40,34■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa40,34■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Fam50bQ9WTJ8 334 aa40,34■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Golga2Q921M4 999 aa40,33■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mast2Q60592 1734 aa40,33■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Kcnh4A2A5F7 1018 aa40,32■■■■■ 4,05
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Iqcf3Q9D498 203 aa40,31■■■■■ 4,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Q4VA45 678 aa40,29■■■■■ 4,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Sik1Q60670 779 aa40,29■■■■■ 4,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Amotl1Q9D4H4 968 aa40,28■■■■■ 4,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Apaf1O88879 1249 aa40,27■■■■■ 4,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa40,27■■■■■ 4,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP40,27■■■■■ 4,04
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Exoc5Q3TPX4 708 aa40,25■■■■■ 4,03
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Znf541Q0GGX2 1363 aa40,24■■■■■ 4,03
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP40,24■■■■■ 4,03
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Nwd2Q6P5U7 1742 aa40,22■■■■■ 4,03
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP40,21■■■■■ 4,03
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP40,2■■■■■ 4,03
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa40,2■■■■■ 4,03
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Speer4bQ9D9F7 267 aa40,2■■■■■ 4,03
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cabp2Q9JLK4 216 aa40,2■■■■■ 4,03
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Taok3Q8BYC6 898 aa40,19■■■■■ 4,02
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tnks1bp1P58871 1720 aa40,18■■■■■ 4,02
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa40,16■■■■■ 4,02
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Tns2Q8CGB6 1400 aa40,16■■■■■ 4,02
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Arfgef2A2A5R2 1792 aa40,16■■■■■ 4,02
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP40,15■■■■■ 4,02
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Uspl1Q3ULM6 1089 aa40,14■■■■■ 4,02
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Usp19Q3UJD6 1360 aa40,14■■■■■ 4,02
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Cavin4A2AMM0 362 aa40,13■■■■■ 4,01
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP40,13■■■■■ 4,01
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP40,13■■■■■ 4,01
Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 Trpm3Q5F4S9 1721 aa40,11■■■■■ 4,01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16,9 ms