RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 RAMP2O60895 175 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOQP17081 205 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CCKBRP32239 447 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RAPGEF1Q13905 1077 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC14Q15048 493 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CDO1Q16878 200 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNJLQ8IV13 435 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6C4Q8NGE1 309 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEH1Q9H213 219 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 KLQ9UEF7 1012 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSL6Q9UKU0 697 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TERTO14746 1132 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 BUB1O43683 1085 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 IGSF6O95976 241 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 SFTPCP11686 197 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ITIH1P19827 911 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM71AQ8IYT1 594 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 EMC1Q8N766 993 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RWDD2AQ9UIY3 292 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 NVLO15381 856 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TMCC1O94876 653 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX5P50542 639 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPK10P53779 464 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 SRP54P61011 504 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RHOAP61586 193 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 NFATC4Q14934 902 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFAND4Q86XD8 727 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 NETO2Q8NC67 525 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ATL2Q8NHH9 583 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 NCAPGQ9BPX3 1015 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM248Q9NWD8 314 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM59LQ9UK28 342 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAMEF10O60809 474 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP11B1P15538 503 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMP2P16035 220 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 WSCD2Q2TBF2 565 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 SMYD5Q6GMV2 418 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 BNIPLQ7Z465 357 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP14Q86W24 1093 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D31Q96DN5 1066 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1A2Q9Y585 309 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 PCCBP05166 539 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ELP6Q0PNE2 266 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TBR1Q16650 682 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB6CQ53S08 254 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CPA5Q8WXQ8 436 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 APOOQ9BUR5 198 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TTYH3Q9C0H2 523 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB6CQ9H0N0 254 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SUV39H1O43463 412 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 KDELR3O43731 214 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PPFIA2O75334 1257 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFP01375 233 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGB6P18564 788 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ADRA1BP35368 520 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 INPP5AQ14642 412 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM52BQ4KMG9 183 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF19Q5T6S3 580 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MANEALQ5VSG8 457 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NAA35Q5VZE5 725 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NYAP1Q6ZVC0 841 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 USP7Q93009 1102 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 VOPP1Q96AW1 172 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR92Q96MX6 357 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CMKLR1Q99788 373 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXJ2Q9P0K8 574 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 DKK3Q9UBP4 350 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM72CH0Y354 149 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 LRIG2O94898 1065 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 LSM8O95777 96 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 SDC4P31431 198 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ETV5P41161 510 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP4F2P78329 520 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 COLEC12Q5KU26 742 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP58Q5T655 872 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM72AQ5TYM5 149 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM72DQ6L9T8 149 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF8Q7Z7C8 310 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM72BQ86X60 149 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM159Q96B96 161 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PDXPQ96GD0 296 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RETREG1Q9H6L5 497 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF215Q9Y6U7 377 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 B4DGG1 531 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGNO95427 931 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF7Q14155 803 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM46DQ8NEK8 389 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR156Q8NFN8 814 aa27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms