RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CCR3P51677 355 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CLCN5P51795 746 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 METAP1P53582 386 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 WNT3AP56704 352 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SLC7A5Q01650 507 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SATB1Q01826 763 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 MPP3Q13368 585 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SEMA5AQ13591 1074 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SPARCL1Q14515 664 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CST6Q15828 149 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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SGMS1-211ENST00000626236 TEX35Q5T0J7 233 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ANO7Q6IWH7 933 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 KDELC1Q6UW63 502 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
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SGMS1-211ENST00000626236 PGBD3Q8N328 593 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 LPCAT1Q8NF37 534 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 VOPP1Q96AW1 172 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ARRDC3Q96B67 414 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 TADA1Q96BN2 335 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC45Q96CN5 670 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 HINFPQ9BQA5 517 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 FICDQ9BVA6 458 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 RAB17Q9H0T7 212 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 DPH5Q9H2P9 285 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 DYRK4Q9NR20 520 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 VPS45Q9NRW7 570 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 CHKBQ9Y259 395 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 SNX24Q9Y343 169 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-211ENST00000626236 C16orf96A6NNT2 1141 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 TK2O00142 265 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 SMAPO00193 183 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PLK4O00444 970 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 GPR37O15354 613 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PSMD3O43242 534 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 HRO43593 1189 aa8.58□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 ALDH1A2O94788 518 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PGLSO95336 258 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 AP2A1O95782 977 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 CPP00450 1065 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 AGTP01019 485 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PDHA1P08559 390 aa8.58□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 C5AR1P21730 350 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 ITGB7P26010 798 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 SLC8A1P32418 973 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 CXCL12P48061 93 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 EPHB1P54762 984 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 GUCY2DQ02846 1103 aa8.58□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 OLIG2Q13516 323 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 GALNT3Q14435 633 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 SLC14A2Q15849 920 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 LRRC73Q5JTD7 316 aa8.58□□□□□ -1.04
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SGMS1-211ENST00000626236 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 PCGF5Q86SE9 256 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 FBXL6Q8N531 539 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A41Q8N5S1 370 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 AADATQ8N5Z0 425 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM105Q8N8V8 129 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 GANCQ8TET4 914 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 CPT1BQ92523 772 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 SNF8Q96H20 258 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 FEM1CQ96JP0 617 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 MRGPRX1Q96LB2 322 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 TBL1YQ9BQ87 522 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 APOL2Q9BQE5 337 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 ERP44Q9BS26 406 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-211ENST00000626236 ADGRE3Q9BY15 652 aa8.58□□□□□ -1.04
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