RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 NLGN3Q9NZ94 848 aa23.79■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 PKD1L2Q7Z442 2459 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 NEMP2A6NFY4 417 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP1A2P05177 515 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 RARAP10276 462 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 PTMSP20962 102 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP4F3Q08477 520 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 ELP6Q0PNE2 266 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 BRAT1Q6PJG6 821 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 ZSWIM9Q86XI8 627 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 NIPA2Q8N8Q9 360 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 RFFLQ8WZ73 363 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 PCDH12Q9NPG4 1184 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 ETNK2Q9NVF9 386 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa23.78■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 H3BRJ5 948 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 K7ESM1 405 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 MUSKO15146 869 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 CKMT1AP12532 417 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 XPAP23025 273 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 AMPD1P23109 780 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 YPEL5P62699 121 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 SMTNL2Q2TAL5 461 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 HS1BP3Q53T59 392 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 HES3Q5TGS1 186 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM181AQ8N9Y4 354 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 BTBD6Q96KE9 485 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 NSMCE3Q96MG7 304 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 SP110Q9HB58 689 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 IP6K2Q9UHH9 426 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 NENFQ9UMX5 172 aa23.77■■□□□ 1.4
PPP1CC-211ENST00000620030 APC2O95996 2303 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 TOR1BO14657 336 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 NEBLO76041 1014 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ALPPL2P10696 532 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 HNF1BP35680 557 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ARL4AP40617 200 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 E2F1Q01094 437 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 NFKBIBQ15653 356 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 TEKT4Q8WW24 435 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 HSPH1Q92598 858 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ECHDC3Q96DC8 303 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 APOLD1Q96LR9 279 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 CSPG4P5Q96PW8 444 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 PSKH2Q96QS6 385 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 NUP85Q9BW27 656 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 U3KQA8 63 aa23.76■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 H3BM21 787 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 PEX11BO96011 259 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 JUNDP17535 347 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 CASP14P31944 242 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 DAB2P98082 770 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC10A7Q0GE19 358 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 PTK2BQ14289 1009 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 AGERQ15109 404 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 WSCD2Q2TBF2 565 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 CCDC122Q5T0U0 273 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF599Q96NL3 588 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 DUSP23Q9BVJ7 150 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 PCDH18Q9HCL0 1135 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ANAPC7Q9UJX3 599 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 COQ6Q9Y2Z9 468 aa23.75■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 AQP9O43315 295 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 MYF5P13349 255 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 IL4RP24394 825 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 SERPINA4P29622 427 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 THOP1P52888 689 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 LRRC14Q15048 493 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 IRF4Q15306 451 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ERAP2Q6P179 960 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 SEPT3Q9UH03 358 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 RAXQ9Y2V3 346 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 ACACAQ13085 2346 aa23.74■■□□□ 1.39
PPP1CC-211ENST00000620030 CFAP69A5D8W1 941 aa23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms