RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	AP4S1	Q9Y587	144 aa		12.85	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A088AWK7	358 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	HMX2	A2RU54	273 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	HGF	P14210	728 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	GSS	P48637	474 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	CHN2	P52757	468 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	PHEX	P78562	749 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	ECT2L	Q008S8	904 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	NEDD8	Q15843	81 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	LPGAT1	Q92604	370 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	ASIC4	Q96FT7	647 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	PLK2	Q9NYY3	685 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	EMCN	Q9ULC0	261 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	LZTS1	Q9Y250	596 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	CEP350	Q5VT06	3117 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449		E9PAM4	449 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449		F5H5T6	163 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	RBP1	P09455	135 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	AKR1A1	P14550	325 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	UQCRB	P14927	111 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	CRABP2	P29373	138 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP51A1	Q16850	503 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	DHFR2	Q86XF0	187 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	VWA7	Q9Y334	891 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	UBXN8	O00124	270 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	GGT5	P36269	586 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	NR6A1	Q15406	480 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	CEP97	Q8IW35	865 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	OR7D4	Q8NG98	312 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		12.84	□□□□□ -0.35
ACSS3-208	ENST00000616449	PIR	O00625	290 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CNTN5	O94779	1100 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SERPINF2	P08697	491 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CTPS1	P17812	591 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PTPRN	Q16849	979 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CES4A	Q5XG92	561 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF145	Q96MT1	663 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	VAT1	Q99536	393 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	BAG5	Q9UL15	447 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ARL5A	Q9Y689	179 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SCN1A	P35498	2009 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CENPF	P49454	3210 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	MYADML2	A6NDP7	307 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449		F8W8V4	182 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	AP3B1	O00203	1094 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PTGES	O14684	152 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	NCK1	P16333	377 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GLUD2	P49448	558 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	DUSP4	Q13115	394 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	INPP5A	Q14642	412 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SYT17	Q9BSW7	474 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		12.83	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		12.83	□□□□□ -0.36

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