RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612980.4

RDM1-215, Transcript of RAD52 motif containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 501 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDM1-215ENST00000612980 CYTH2Q99418 400 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 CDC6Q99741 560 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 VPS37BQ9H9H4 285 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 ETNK1Q9HBU6 452 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 GKN1Q9NS71 199 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 ABCF3Q9NUQ8 709 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 KLHL14Q9P2G3 628 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 KANSL3Q9P2N6 904 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 MTRRQ9UBK8 725 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 HESX1Q9UBX0 185 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 GRID1Q9ULK0 1009 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 SNX9Q9Y5X1 595 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 USP3Q9Y6I4 520 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.86□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 LRBAP50851 2863 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 A8MXQ7 604 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 H0YHG0 523 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 GOLGA8MH3BSY2 632 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 H7C0C1 242 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 I3L4J1 428 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 PRRG1O14668 218 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 ZNF197O14709 1029 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 KLF11O14901 512 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 EFSO43281 561 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 SEMA7AO75326 666 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 SPAG7O75391 227 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 TADA2AO75478 443 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 BANF1O75531 89 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 GRAP2O75791 330 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 ALDH1A2O94788 518 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 AGFG2O95081 481 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 MPOP05164 745 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 T-ENOLP0DO92 83 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 MLNP12872 115 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 CCNB1P14635 433 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 KRT15P19012 456 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 KRT4P19013 534 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 TPSB2P20231 275 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 DRD1P21728 446 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 CYP2F1P24903 491 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 SDC4P31431 198 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 GJA4P35212 333 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 NOS2P35228 1153 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 HNF1BP35680 557 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 MATKP42679 507 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 ATP5OP48047 213 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 HCAR3P49019 387 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 RGS7P49802 495 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 NEK3P51956 506 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 BCAT1P54687 386 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 EPHA5P54756 1037 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 LILRA4P59901 499 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 NCALDP61601 193 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 CDK16Q00536 496 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 CDK18Q07002 472 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 BST2Q10589 180 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 TWF1Q12792 350 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 SEMA5AQ13591 1074 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 RUNX3Q13761 415 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 KRT81Q14533 505 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 TMED2Q15363 201 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 TPSAB1Q15661 275 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 PARP6Q2NL67 630 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 HLA-BQ31612 363 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 BBS9Q3SYG4 887 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 SLC45A4Q5BKX6 768 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 ICE2Q659A1 982 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 SCYL2Q6P3W7 929 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 CYB5D1Q6P9G0 228 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 FBXL19Q6PCT2 694 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 LAYNQ6UX15 382 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 SLC26A11Q86WA9 606 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 OSTM1Q86WC4 334 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 CHSY1Q86X52 802 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 PARP9Q8IXQ6 854 aa4.85□□□□□ -1.63
RDM1-215ENST00000612980 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms