RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 H3BQV1 296 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ALOX15BO15296 676 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 FAM155BO75949 473 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ADORA2BP29275 332 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CASP5P51878 434 aa11.88□□□□□ -0.51
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HCG18-241ENST00000602290 DTHD1Q6ZMT9 781 aa11.88□□□□□ -0.51
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HCG18-241ENST00000602290 ZFAND2BQ8WV99 257 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ACCSQ96QU6 501 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.88□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
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HCG18-241ENST00000602290 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 IRAK2O43187 625 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CBX6O95503 412 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CTSLP07711 333 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ATICP31939 592 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 GCKP35557 465 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 GNGT1P63211 74 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 NNTQ13423 1086 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 RIPK1Q13546 671 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 PHF19Q5T6S3 580 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 C6orf89Q6UWU4 347 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 APCDD1Q8J025 514 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 OR6C4Q8NGE1 309 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 HAPLN3Q96S86 360 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 EFHD1Q9BUP0 239 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SLC40A1Q9NP59 571 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 GULP1Q9UBP9 304 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 KCND3Q9UK17 655 aa11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD65E5RJM6 399 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 NDUFAB1O14561 156 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 MCF2LO15068 1137 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SERPINC1P01008 464 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 IGLV3-27P01718 113 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 TCN2P20062 427 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 PTGER4P35408 488 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 NDST1P52848 882 aa11.86□□□□□ -0.51
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HCG18-241ENST00000602290 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CERCAMQ5T4B2 595 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.86□□□□□ -0.51
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HCG18-241ENST00000602290 LVRNQ6Q4G3 990 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa11.86□□□□□ -0.51
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HCG18-241ENST00000602290 UNC5BQ8IZJ1 945 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 NECAB1Q8N987 351 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 TC2NQ8N9U0 490 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 GPR156Q8NFN8 814 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
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HCG18-241ENST00000602290 HSD3B7Q9H2F3 369 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 RUBCNLQ9H714 662 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
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HCG18-241ENST00000602290 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.86□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ZNF233A6NK53 670 aa11.85□□□□□ -0.51
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HCG18-241ENST00000602290 MSI1O43347 362 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
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HCG18-241ENST00000602290 PNLIPP16233 465 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ITGA3P26006 1051 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 XRCC4Q13426 336 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CDH18Q13634 790 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 NR6A1Q15406 480 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 C16orf46Q6P387 395 aa11.85□□□□□ -0.51
HCG18-241ENST00000602290 FAM173BQ6P4H8 233 aa11.85□□□□□ -0.51
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