RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578773.1

GGA3-206, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 5

Gene GGA3, Length 432 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-206	ENST00000578773	MUC3B	Q9H195	1237 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	FGF22	Q9HCT0	170 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	KL	Q9UEF7	1012 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	TMEM202	A6NGA9	273 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	NEMP1	O14524	444 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	TSPAN6	O43657	245 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	PPP6R2	O75170	966 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	KATNA1	O75449	491 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	IGLV3-25	P01717	112 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	APOE	P02649	317 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	CD19	P15391	556 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	BLK	P51451	505 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	DNA2	P51530	1060 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	SLC8A3	P57103	927 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	SEMA5A	Q13591	1074 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	NR1D2	Q14995	579 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	ALF	Q53S48	1182 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	OR7D4	Q8NG98	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	TMC2	Q8TDI7	906 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	APOO	Q9BUR5	198 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	RTTN	Q86VV8	2226 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773		A6NCN8	305 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	AREL1	O15033	823 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	PPM1D	O15297	605 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	MAP3K6	O95382	1288 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	MC2R	Q01718	297 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	PTK2	Q05397	1052 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	NNT	Q13423	1086 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	INPP5A	Q14642	412 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	E2F4	Q16254	413 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	NRROS	Q86YC3	692 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	CCDC114	Q96M63	670 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773		H3BQV1	296 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	LRRTM2	O43300	516 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	TM7SF2	O76062	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	ECEL1	O95672	775 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	TNF	P01375	233 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	PCCB	P05166	539 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	FGF1	P05230	155 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	SETSIP	P0DME0	302 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	CCL11	P51671	97 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	VAMP7	P51809	220 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	RAB15	P59190	212 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	ARTN	Q5T4W7	220 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	PELI3	Q8N2H9	469 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GGA3-206	ENST00000578773	WDR92	Q96MX6	357 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms