RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566279.5

TCF4-231, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5 BASIC

Gene TCF4, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-231	ENST00000566279	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CHKB	Q9Y259	395 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	BIRC5	O15392	142 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	RAMP2	O60895	175 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NEBL	O76041	1014 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MMP2	P08253	660 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	IRF1	P10914	325 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	HDC	P19113	662 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SLC6A4	P31645	630 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ABCG1	P45844	678 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MAPKAPK2	P49137	400 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SERPINB8	P50452	374 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NCALD	P61601	193 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MTA1	Q13330	715 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MPP3	Q13368	585 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	GRM2	Q14416	872 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	IHH	Q14623	411 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PARP15	Q460N3	678 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PPM1J	Q5JR12	505 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	C16orf46	Q6P387	395 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	LEMD2	Q8NC56	503 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ASB16	Q96NS5	453 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TASP1	Q9H6P5	420 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	GKN1	Q9NS71	199 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279		H0YHG0	523 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PLIN3	O60664	434 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TGDS	O95455	350 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TYK2	P29597	1187 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	GMPR	P36959	345 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ACVRL1	P37023	503 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	AVPR1A	P37288	418 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CHRNA4	P43681	627 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MAX	P61244	160 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	DSC2	Q02487	901 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	BST1	Q10588	318 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	SERINC3	Q13530	473 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CHI3L2	Q15782	390 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MARC1	Q5VT66	337 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PACS2	Q86VP3	889 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	LGI2	Q8N0V4	545 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PGBD5	Q8N414	524 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	E2F7	Q96AV8	911 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ERP27	Q96DN0	273 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NACA2	Q9H009	215 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ECT2	Q9H8V3	914 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	FAM50B	Q9Y247	325 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CPQ	Q9Y646	472 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279		F5H5T6	163 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	TIMM44	O43615	452 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ACSL4	O60488	711 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	DCTN3	O75935	186 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	PROC	P04070	461 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ARNT	P27540	789 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ALDH3A1	P30838	453 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	OR1E1	P30953	314 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	CD86	P42081	329 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TCF4-231	ENST00000566279	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77

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