RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 LPIN1Q14693 890 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRRC43Q8N309 656 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP33Q8TEY7 942 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF34Q969K3 372 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RTP3Q9BQQ7 232 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TASP1Q9H6P5 420 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TLK1Q9UKI8 766 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPRDP23468 1912 aa20.5■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PATJQ8NI35 1801 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARL5CA6NH57 179 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TXNDC9O14530 226 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RFC2P35250 354 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 C16orf89Q6UX73 402 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TMEM151AQ8N4L1 468 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCF7L2Q9NQB0 619 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC78A2IDD5 438 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TK2O00142 265 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CXCL10P02778 98 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SRGAP2BP0DMP2 458 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 THRAP10827 490 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 BMP8BP34820 402 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCNN1GP51170 649 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYBPC1Q00872 1141 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PEX6Q13608 980 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNGA3Q16281 694 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 LIPMQ5VYY2 423 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 DBF4BQ8NFT6 615 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGR3Q8TD06 166 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 OR52B2Q96RD2 323 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 DRC3Q9H069 523 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 NEU3Q9UQ49 428 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.49■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CHRNGP07510 517 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SBK3P0C264 359 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CDK4P11802 303 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCNCP24863 283 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 MPSTP25325 297 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRKAA2P54646 552 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 HERC3Q15034 1050 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 UPP1Q16831 310 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PCID2Q5JVF3 399 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 DFFAO00273 331 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 MATN2O00339 956 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZMPSTE24O75844 475 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 FGBP02675 491 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 BDNFP23560 247 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CD52P31358 61 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PPP2R5DQ14738 602 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYLK3Q32MK0 819 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM171BQ6P995 826 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 TDHQ8IZJ6 230 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SCML4Q8N228 414 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PARNO95453 639 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGLV3-25P01717 112 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 ODC1P11926 461 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SAT1P21673 171 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 GABRB3P28472 473 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 GRIA4P48058 902 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC12A1Q13621 1099 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIGGQ5H8A4 983 aa20.47■□□□□ 0.87
CCNDBP1-205ENST00000564630 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms