RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562291.2

INO80E-204, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-204ENST00000562291 BTBD6Q96KE9 485 aa9.77□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.77□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 NUP85Q9BW27 656 aa9.77□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.77□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 PDFQ9HBH1 243 aa9.77□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 URB1O60287 2271 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TOR1BO14657 336 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 SPINT1O43278 529 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 CBFA2T2O43439 604 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TCF4P15884 667 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 ACP1P24666 158 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 SERPINA4P29622 427 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 CLDN6P56747 220 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 PFN3P60673 137 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 CAMK2BQ13554 666 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 DPYSQ14117 519 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 KRT81Q14533 505 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 LBRQ14739 615 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 LRRC14Q15048 493 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 FAXCQ5TGI0 409 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TMCO3Q6UWJ1 677 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 PROSER1Q86XN7 944 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 LMX1AQ8TE12 382 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 DUSP23Q9BVJ7 150 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 PCDH12Q9NPG4 1184 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 ETNK2Q9NVF9 386 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 SPASTQ9UBP0 616 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 SEPT3Q9UH03 358 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 COQ6Q9Y2Z9 468 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.76□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 K7ESM1 405 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 AQP9O43315 295 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 NEBLO76041 1014 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 MT-CO3P00414 261 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 GYPCP04921 128 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 PRKCGP05129 697 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 GIMD1P0DJR0 217 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 CKMT1AP12532 417 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 MYF5P13349 255 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 IGFALSP35858 605 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 RGRP47804 291 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 LIG3P49916 1009 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 ADKP55263 362 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 CDH6P55285 790 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 SEMG2Q02383 582 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 C1orf61Q13536 156 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 DPYSL2Q16555 572 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 HES3Q5TGS1 186 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 KDM7AQ6ZMT4 941 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 PARGQ86W56 976 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 BBS5Q8N3I7 341 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 NPWQ8N729 165 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 KCTD6Q8NC69 237 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 OR8K1Q8NGG5 319 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 TEKT4Q8WW24 435 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 APOLD1Q96LR9 279 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 ZNF599Q96NL3 588 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 CSPG4P5Q96PW8 444 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 IL12RB2Q99665 862 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 APOOQ9BUR5 198 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 ABCG4Q9H172 646 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 GPR27Q9NS67 375 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 KLF15Q9UIH9 416 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 AK5Q9Y6K8 562 aa9.75□□□□□ -0.85
INO80E-204ENST00000562291 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms