RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TCHH	Q07283	1943 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PFAS	O15067	1338 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ELP1	O95163	1332 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934		A0A087WWV3	80 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PP2D1	A8MPX8	630 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934		M0QYT0	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	NEMF	O60524	1076 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	C1QL1	O75973	258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ACTL6B	O94805	426 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MT-CO3	P00414	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CMA1	P23946	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CCND2	P30279	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GALNS	P34059	522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GRK6	P43250	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ME1	P48163	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SOX10	P56693	466 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GPC5	P78333	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	STXBP2	Q15833	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CALCRL	Q16602	461 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CCL14	Q16627	93 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MECR	Q9BV79	373 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LINS1-210	ENST00000560934	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		4.84	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GVL5	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ASB14	A6NK59	587 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CLIC1	O00299	241 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	LAD1	O00515	517 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PSMD10	O75832	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	BMP15	O95972	392 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	HOXC6	P09630	235 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	MMP8	P22894	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ICAM3	P32942	547 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PRPH	P41219	470 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2H	P62256	183 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	AP2B1	P63010	937 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	CFHR3	Q02985	330 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	PDIA5	Q14554	519 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LINS1-210	ENST00000560934	TAF5	Q15542	800 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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