RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 TRNP1Q6NT89 227 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 GLRX5Q86SX6 157 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PIP4P1Q86T03 277 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SRLQ86TD4 932 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PARGQ86W56 976 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM72BQ86X60 149 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 TMTC1Q8IUR5 882 aa5.67□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.67□□□□□ -1.5
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CLSTN3-215ENST00000544584 WDR48Q8TAF3 677 aa5.67□□□□□ -1.5
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CLSTN3-215ENST00000544584 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.67□□□□□ -1.5
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CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 CSPG4P5Q96PW8 444 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 PSKH2Q96QS6 385 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 IL12RB2Q99665 862 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.66□□□□□ -1.5
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC39A8Q9C0K1 460 aa5.66□□□□□ -1.5
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