RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527446.5

RPS3-209, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPS3, Length 1,306 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-209ENST00000527446 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 CHKBQ9Y259 395 aa12.86□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 EML5Q05BV3 1969 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 C10orf142B7Z368 130 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 SPINT1O43278 529 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ALDH1A2O94788 518 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 SUN1O94901 812 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 AP2A1O95782 977 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 AGTP01019 485 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ACTN2P35609 894 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 P2RY2P41231 377 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 PXNP49023 591 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 TPMTP51580 245 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 TAS2R38P59533 333 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 CDK18Q07002 472 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 CNTN1Q12860 1018 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 OLIG2Q13516 323 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 SPARCL1Q14515 664 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 PRPSAP1Q14558 356 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 KCNJ11Q14654 390 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 PPP1R7Q15435 360 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 BRAT1Q6PJG6 821 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 TSSK4Q6SA08 328 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 MAATS1Q7Z4T9 603 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 CACUL1Q86Y37 369 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 CPT1BQ92523 772 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 NELL1Q92832 810 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 FEM1CQ96JP0 617 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 SMIM14Q96QK8 99 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 SCML1Q9UN30 329 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 PPIL1Q9Y3C6 166 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa12.85□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 A0A1W2PP55 124 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 AREL1O15033 823 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 LAMTOR5O43504 91 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 NDST3O95803 873 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 DNTTP04053 509 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ITIH2P19823 946 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ADCY8P40145 1251 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ABL2P42684 1182 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 RPL26P61254 145 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 PTPRRQ15256 657 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 PCSK7Q16549 785 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 QPCTQ16769 361 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 UGP2Q16851 508 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 SYCP2LQ5T4T6 812 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ARMC12Q5T9G4 340 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 AGBL4Q5VU57 503 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ANKRD22Q5VYY1 191 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 DUPD1Q68J44 220 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 USP30Q70CQ3 517 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 KDELC2Q7Z4H8 507 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 HDDC3Q8N4P3 179 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 IPMKQ8NFU5 416 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 CCHCR1Q8TD31 782 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 SEC14L1Q92503 715 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ERP44Q9BS26 406 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 NEUROG2Q9H2A3 272 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 ARNT2Q9HBZ2 717 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 FBXL12Q9NXK8 326 aa12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
RPS3-209ENST00000527446 GON4LQ3T8J9 2241 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 ABCA7Q8IZY2 2146 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 A0A1W2PQ67 120 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 UPK3BL1B0FP48 263 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 ANKRD66B4E2M5 251 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 UPK3BL2E5RIL1 263 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 PSMD3O43242 534 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 USP12O75317 370 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 APRTP07741 180 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 ADRB3P13945 408 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 TPSB2P20231 275 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 GRIA1P42261 906 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 CHRNA4P43681 627 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 RPL21P46778 160 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 NEK3P51956 506 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 BASP1P80723 227 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 SLC7A5Q01650 507 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 TRADDQ15628 312 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 TPSAB1Q15661 275 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 SLC1A5Q15758 541 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 CDKN3Q16667 212 aa12.83□□□□□ -0.36
RPS3-209ENST00000527446 MAP7D1Q3KQU3 841 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms