RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512069.6

PDE4D-220, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4D, Length 536 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-220ENST00000512069 PPP3CCP48454 512 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 ANKRD1Q15327 319 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 RPE65Q16518 533 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 KLHL22Q53GT1 634 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 MIB2Q96AX9 1013 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 TECPR2O15040 1411 aa4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 IFT172Q9UG01 1749 aa4.85□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 SBNO1A3KN83 1393 aa4.84□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 A0A1B0GVT2 93 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 VWA5AO00534 786 aa4.84□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 DSC1Q08554 894 aa4.84□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.84□□□□□ -1.63
PDE4D-220ENST00000512069 Q6ZSV7 163 aa4.84□□□□□ -1.63
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PDE4D-220ENST00000512069 SERPINC1P01008 464 aa4.82□□□□□ -1.64
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PDE4D-220ENST00000512069 TMPRSS3P57727 454 aa4.82□□□□□ -1.64
PDE4D-220ENST00000512069 SLC15A2Q16348 729 aa4.82□□□□□ -1.64
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