RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 VPS52Q8N1B4 723 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 KRT78Q8N1N4 520 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 C16orf52Q8NHV5 167 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF606Q8WXB4 792 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CFAP36Q96G28 342 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 SUCLG2Q96I99 432 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LRRCC1Q9C099 1032 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC68Q9H2F9 335 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 IL20Q9NYY1 176 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 COL20A1Q9P218 1284 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 FBXL5Q9UKA1 691 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa3.2□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 SH3TC1Q8TE82 1336 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 PRR23AA6NEV1 266 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ISM1B1AKI9 464 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 FAM227AF5H4B4 570 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 RTCAO00442 366 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 SOCS2O14508 198 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 DYNC1I1O14576 645 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 KRT86O43790 486 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 PLOD3O60568 738 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 NBNO60934 754 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 STAM2O75886 525 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 PIAS2O75928 621 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 AGR2O95994 175 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TNNT1P13805 278 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 IL1R1P14778 569 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CAPN3P20807 821 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 KLRC1P26715 233 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 NTSR1P30989 418 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 S100A5P33763 92 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 MCM5P33992 734 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 GALNSP34059 522 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CD86P42081 329 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 PEX5P50542 639 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 RPS6KA3P51812 740 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LIMK1P53667 647 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LINC00205P59089 165 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 PLIN5Q00G26 463 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CYP4A11Q02928 519 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ICA1Q05084 483 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF91Q05481 1191 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ZBTB17Q13105 803 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LAMB3Q13751 1172 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ARHGEF7Q14155 803 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 KRT81Q14533 505 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 COG2Q14746 738 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 RAB30Q15771 203 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TRIM60Q495X7 471 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 BOLA3Q53S33 107 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 C10orf25Q5T742 122 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 HHATQ5VTY9 493 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC30Q5VVM6 783 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 RUFY3Q7L099 469 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ASCL5Q7RTU5 278 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM110Q86TL2 294 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 SESTD1Q86VW0 696 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LIX1LQ8IVB5 337 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TCEAL8Q8IYN2 117 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LRRC43Q8N309 656 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 CARNMT1Q8N4J0 409 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 ERMNQ8TAM6 284 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 FAM76AQ8TAV0 307 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 GOLGA5Q8TBA6 731 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 KIAA1524Q8TCG1 905 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TEKT4Q8WW24 435 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 TRIB2Q92519 343 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 LRRC45Q96CN5 670 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 HIC2Q96JB3 615 aa3.19□□□□□ -1.9
ATXN3-211ENST00000511362 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms