RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465576.1

CLRN1-AS1-201, CLRN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLRN1-AS1, Length 2,045 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.47□□□□□ -1.37
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CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FBF1Q8TES7 1133 aa6.47□□□□□ -1.37
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CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.47□□□□□ -1.37
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CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 COL4A3Q01955 1670 aa6.47□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.46□□□□□ -1.37
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 MAGEB16A2A368 324 aa6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ANTXRLA6NF34 631 aa6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 WASH3PC4AMC7 463 aa6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 RASGRF2O14827 1237 aa6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 TIMM44O43615 452 aa6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 SPAG6O75602 509 aa6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 GSRP00390 522 aa6.46□□□□□ -1.38
CLRN1-AS1-201ENST00000465576 PRLP01236 227 aa6.46□□□□□ -1.38
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