RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R3AQ16821 1122 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TBCELQ5QJ74 424 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SMYD5Q6GMV2 418 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 IGFN1Q86VF2 1251 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM35BQ8NCS4 154 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 OR10T2Q8NGX3 314 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC13A3Q8WWT9 602 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PPP1R14AQ96A00 147 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 MAN1C1Q9NR34 630 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 RNF112Q9ULX5 631 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 WDR64B1ANS9 1081 aa5.63□□□□□ -1.51
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PTPRC-209ENST00000442510 PTTG1O95997 202 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SERPINA1P01009 418 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 HPCAL1P37235 193 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CSKP41240 450 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GRIA2P42262 883 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CDKN2CP42773 168 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ITGA1P56199 1179 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 POU4F1Q01851 419 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GRIK4Q16099 956 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PYDC2Q56P42 97 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD40Q6AI12 368 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 XRRA1Q6P2D8 792 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CREG2Q8IUH2 290 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF283Q8N7M2 679 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 HYLS1Q96M11 299 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FRMD6Q96NE9 622 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MEIS3Q99687 375 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NEURL2Q9BR09 285 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CABP5Q9NP86 173 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CASS4Q9NQ75 786 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NLRP1Q9C000 1473 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FHOD3Q2V2M9 1422 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RD3LP0DJH9 198 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PDGFRAP16234 1089 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FGFR3P22607 806 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CHMP24386 653 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 BMI1P35226 326 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TIE1P35590 1138 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF81P51508 661 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NME5P56597 212 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 KCNK10P57789 538 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GRIK5Q16478 980 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RTN1Q16799 776 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 C2CD6Q53TS8 623 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC66Q68CR7 880 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 OR6C4Q8NGE1 309 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CRB3Q9BUF7 120 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CLPBQ9H078 707 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC19Q9H756 370 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ARL8BQ9NVJ2 186 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 B3GNT2Q9NY97 397 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 VAPAQ9P0L0 249 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PHF11Q9UIL8 331 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SARDHQ9UL12 918 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PADI2Q9Y2J8 665 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 UTYO14607 1347 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TSPAN19P0C672 248 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MASP1P48740 699 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 IL5RAQ01344 420 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 DSC1Q08554 894 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TCIRG1Q13488 830 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SELPLGQ14242 412 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GPR176Q14439 515 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 BATFQ16520 125 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MAN2A1Q16706 1144 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TRAPPC3LQ5T215 181 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.62□□□□□ -1.51
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