RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SCINQ9Y6U3 715 aa11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CPED1A4D0V7 1026 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 AQP9O43315 295 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CREB3O43889 395 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ENDOD1O94919 500 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 MYBL1P10243 752 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 GZMAP12544 262 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ITGB7P26010 798 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 OGDHQ02218 1023 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 LY6DQ14210 128 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 C5orf22Q49AR2 442 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TMEM259Q4ZIN3 620 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CCDC122Q5T0U0 273 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ZNF783Q6ZMS7 281 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 KLK6Q92876 244 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 RAB7BQ96AH8 199 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 CCDC42Q96M95 316 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SPON2Q9BUD6 331 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TRIM7Q9C029 511 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 FZD3Q9NPG1 666 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 GPR27Q9NS67 375 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 OR51B4Q9Y5P0 310 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 TRPM6Q9BX84 2022 aa11.84□□□□□ -0.51
PRAME-210ENST00000442481 A0A087X0T9 212 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 DRGXA6NNA5 263 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 FAM72CH0Y354 149 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 NEMP1O14524 444 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 TOR1BO14657 336 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP6O43182 974 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN6O43657 245 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 AP1G1O43747 822 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 AKR1B10O60218 316 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SNAP91O60641 907 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 RNF8O76064 485 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 LRIG2O94898 1065 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 WISP1O95388 367 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CTSLP07711 333 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ITGA2BP08514 1039 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 FAM228BP0C875 321 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 GIMD1P0DJR0 217 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SFTPCP11686 197 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 JUNDP17535 347 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 THOP1P52888 689 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CLDN2P57739 230 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SKOR1P84550 965 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SPIDRQ14159 915 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CDKN3Q16667 212 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ARSIQ5FYB1 569 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 FAM72AQ5TYM5 149 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 FAM72DQ6L9T8 149 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 C22orf39Q6P5X5 142 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 LINGO4Q6UY18 593 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CLEC14AQ86T13 490 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 FAM72BQ86X60 149 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ZNF683Q8IZ20 524 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 OR7D4Q8NG98 312 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ASB12Q8WXK4 309 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 NTAN1Q96AB6 310 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 TBATAQ96M53 351 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 STRADBQ9C0K7 418 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 THAP2Q9H0W7 228 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 DNAI1Q9UI46 699 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 VPS51Q9UID3 782 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.83□□□□□ -0.52
PRAME-210ENST00000442481 DOCK9Q9BZ29 2069 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms