RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 KLHDC9Q8NEP7 349 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 KCTD4Q8WVF5 259 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 NPAS2Q99743 824 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TRHDEQ9UKU6 1024 aa24.76■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TARM1B6A8C7 271 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 GOLGA8TH3BQL2 631 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SAT1P21673 171 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SLC12A1Q13621 1099 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PTK2BQ14289 1009 aa24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM88BA6NKF7 163 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 F8W810 466 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 H0YJX3 145 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 AOC2O75106 756 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SLC35E2BP0CK96 405 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 NMBRP28336 390 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 MGAT5BQ3V5L5 792 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ASB9Q96DX5 294 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 APOL2Q9BQE5 337 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CIDEBQ9UHD4 219 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TRPA1O75762 1119 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 IGLV3-25P01717 112 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 COL6A2P12110 1019 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 DNAJB1P25685 340 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 IL23RQ5VWK5 629 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 AMIGO2Q86SJ2 522 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 KDM1BQ8NB78 822 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 FAM156AQ8NDB6 213 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 EME1Q96AY2 570 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 UROC1Q96N76 676 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 OSBPL2Q9H1P3 480 aa24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PATJQ8NI35 1801 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 DLX3O60479 287 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TPH1P17752 444 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 NFKB1P19838 968 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PGGT1BP53609 377 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 DPF3Q92784 378 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ATP6V1E2Q96A05 226 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SUSD3Q96L08 255 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 VAT1Q99536 393 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CEPT1Q9Y6K0 416 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CDK4P11802 303 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ELNP15502 786 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PCSK6P29122 969 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SLC5A2P31639 672 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 AVPR1AP37288 418 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PSMD8P48556 350 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 BEND5Q7L4P6 421 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TEKT5Q96M29 485 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ADA2Q9NZK5 511 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 XPR1Q9UBH6 696 aa24.73■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 C8BP07358 591 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PAX3P23760 479 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TSPY1Q01534 308 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 MYBPC3Q14896 1274 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF597Q96LX8 424 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 HAUS8Q9BT25 410 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TRIM62Q9BVG3 475 aa24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TRPC5OSA6NMA1 111 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 H3BSA7 217 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 JCHAINP01591 159 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PSME3P61289 254 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 CEP70Q8NHQ1 597 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SIK2Q9H0K1 926 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 RNF186Q9NXI6 227 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 NEU3Q9UQ49 428 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 NOD1Q9Y239 953 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 AP4S1Q9Y587 144 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 C7orf72A4D263 438 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 SDHDO14521 159 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 NPHS1O60500 1241 aa24.71■■□□□ 1.55
FAAP20-206ENST00000414253 TRMUO75648 421 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms