RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 IFT20Q8IY31 132 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 LILRB2Q8N423 598 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 APPL2Q8NEU8 664 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.78□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 CLDN23Q96B33 292 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 PGBD4Q96DM1 585 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MS4A14Q96JA4 679 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 TNIP3Q96KP6 325 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 UROC1Q96N76 676 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 ZNF558Q96NG5 402 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 MCEEQ96PE7 176 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 APOL6Q9BWW8 343 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.78□□□□□ -1.32
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CCL20-202ENST00000409189 ZBP1Q9H171 429 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 VPS11Q9H270 941 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SYNCQ9H7C4 482 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 VIPAS39Q9H9C1 493 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 GDF3Q9NR23 364 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 SPG21Q9NZD8 308 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 EHD2Q9NZN4 543 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 RAB23Q9ULC3 237 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.78□□□□□ -1.32
CCL20-202ENST00000409189 A0A0U1RQF3 1178 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ZNF839A8K0R7 811 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 KPNA7A9QM74 516 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PPEF2O14830 753 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 FZD7O75084 574 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 C1QL1O75973 258 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 IL18BPO95998 194 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CALCAP01258 141 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ERBB2P04626 1255 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 RPL9P32969 192 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MLH1P40692 756 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CETN2P41208 172 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 GPD2P43304 727 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MARCKSL1P49006 195 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 GPR85P60893 370 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 XYLT1Q86Y38 959 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PALM2Q8IXS6 379 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 VPS52Q8N1B4 723 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 EXD1Q8NHP7 514 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 FGF14Q92915 247 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SLCO2A1Q92959 643 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CAVIN3Q969G5 261 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 C18orf8Q96DM3 657 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MCRS1Q96EZ8 462 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PKNOX2Q96KN3 472 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 KRT12Q99456 494 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ADAM2Q99965 735 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.77□□□□□ -1.33
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CCL20-202ENST00000409189 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 RSAD1Q9HA92 442 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 HESX1Q9UBX0 185 aa6.77□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 CLUHO75153 1309 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 A8MXQ7 604 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 ACOT7O00154 380 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 PODXLO00592 558 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 MAP2K7O14733 419 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 RAD51CO43502 376 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 HUS1O60921 280 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 THP07101 528 aa6.76□□□□□ -1.33
CCL20-202ENST00000409189 KRT7P08729 469 aa6.76□□□□□ -1.33
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