RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409006.3

KDELR3-202, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-202ENST00000409006 HS1BP3Q53T59 392 aa22.72■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.72■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 CLCA2Q9UQC9 943 aa22.72■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 DFFAO00273 331 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 FANCCQ00597 558 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 DPYSQ14117 519 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 UGP2Q16851 508 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 FIGNQ5HY92 759 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 FAM181AQ8N9Y4 354 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 NXPE2Q96DL1 559 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 DONSONQ9NYP3 566 aa22.71■■□□□ 1.23
KDELR3-202ENST00000409006 CACNA1GO43497 2377 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 H3BM21 787 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 MUSKO15146 869 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 AQP9O43315 295 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 GCATO75600 419 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 PALMO75781 387 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ALPPL2P10696 532 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 E2F1Q01094 437 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 IRF4Q15306 451 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SRLQ86TD4 932 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 LMX1AQ8TE12 382 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 AK5Q9Y6K8 562 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SCINQ9Y6U3 715 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ITPR1Q14643 2758 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 NBEAQ8NFP9 2946 aa22.7■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 MT-CO3P00414 261 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 XPAP23025 273 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 HCAR3P49019 387 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 THOP1P52888 689 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 C1orf61Q13536 156 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 RTP5Q14D33 572 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SMTNL2Q2TAL5 461 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 BTBD6Q96KE9 485 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 DUSP23Q9BVJ7 150 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SP110Q9HB58 689 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa22.69■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 OPA1O60313 960 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 MYBL1P10243 752 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 C6P13671 934 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 AMPD1P23109 780 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 PCK1P35558 622 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CSNK1DP48730 415 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SUOXP51687 545 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 YPEL5P62699 121 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 IL10RBQ08334 325 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ELP6Q0PNE2 266 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 GRM3Q14832 879 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CDKN3Q16667 212 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CDCP2Q5VXM1 449 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 PHACTR4Q8IZ21 702 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CPLX3Q8WVH0 158 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 TRIM11Q96F44 468 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CRELD1Q96HD1 420 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 DCBLD2Q96PD2 775 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 LRRC61Q9BV99 259 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.68■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 KIF26BQ2KJY2 2108 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 A0A087WV48 116 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 A0A1W2PQJ5 194 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 MMP12P39900 470 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 LIG3P49916 1009 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 UBASH3AP57075 661 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 PTK2BQ14289 1009 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 DPYSL2Q16555 572 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 MACC1Q6ZN28 852 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 PDZD3Q86UT5 571 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 IFI44Q8TCB0 444 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 HSPH1Q92598 858 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 CLPBQ9H078 707 aa22.67■■□□□ 1.22
KDELR3-202ENST00000409006 THAP2Q9H0W7 228 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms